RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403441.1

PRAME-204, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-204ENST00000403441 AGAP20933 346 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 PMP22Q01453 160 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 CAV1Q03135 178 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 ACER2Q5QJU3 275 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 BEST3Q8N1M1 668 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 OR9A4Q8NGU2 314 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 ASB11Q8WXH4 323 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 ZNF354BQ96LW1 612 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 GPR21Q99679 349 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 TRIM8Q9BZR9 551 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 RAB17Q9H0T7 212 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 SYNPO2LQ9H987 977 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 TACC2O95359 2948 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 NSA2O95478 260 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 TSPAN12O95859 305 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 SSTR2P30874 369 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 AGTR2P50052 363 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 GUCY2DQ02846 1103 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 CALCOCO2Q13137 446 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 TRADDQ15628 312 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 EXT1Q16394 746 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 C3AR1Q16581 482 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 KRTCAP3Q53RY4 240 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 LANCL3Q6ZV70 420 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 SLC26A11Q86WA9 606 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 MMGT1Q8N4V1 131 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 PPFIBP2Q8ND30 876 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 FBXO25Q8TCJ0 367 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 ZNF480Q8WV37 535 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 CYTH2Q99418 400 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 CCDC68Q9H2F9 335 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 DPH5Q9H2P9 285 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 KCNK13Q9HB14 408 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 SLC17A6Q9P2U8 582 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 TINAGQ9UJW2 476 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 PSAT1Q9Y617 370 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 DCHS2Q6V1P9 2916 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-204ENST00000403441 E7ENX8 843 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-204ENST00000403441 CD46P15529 392 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-204ENST00000403441 HRH2P25021 359 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-204ENST00000403441 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
PRAME-204ENST00000403441 XCR1P46094 333 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-204ENST00000403441 EFNA3P52797 238 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-204ENST00000403441 CDKN2DP55273 166 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-204ENST00000403441 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
PRAME-204ENST00000403441 ADORA2A-AS1P86434 159 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-204ENST00000403441 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
PRAME-204ENST00000403441 TAP2Q03519 686 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-204ENST00000403441 MGAT5Q09328 741 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-204ENST00000403441 TUBA3CQ13748 450 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-204ENST00000403441 OR1C1Q15619 314 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-204ENST00000403441 MEP1AQ16819 746 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-204ENST00000403441 FCRLBQ6BAA4 426 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-204ENST00000403441 TUBA3EQ6PEY2 450 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-204ENST00000403441 PLD3Q8IV08 490 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-204ENST00000403441 ANKMY2Q8IV38 441 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-204ENST00000403441 SPNS2Q8IVW8 549 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-204ENST00000403441 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
PRAME-204ENST00000403441 ZBED8Q8IZ13 594 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-204ENST00000403441 SLC5A8Q8N695 610 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-204ENST00000403441 HORMAD2Q8N7B1 307 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-204ENST00000403441 TMEM178AQ8NBL3 297 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-204ENST00000403441 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
PRAME-204ENST00000403441 OR51Q1Q8NH59 317 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-204ENST00000403441 CFAP36Q96G28 342 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-204ENST00000403441 GPR137Q96N19 417 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-204ENST00000403441 NDNQ99608 321 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-204ENST00000403441 GPAMQ9HCL2 828 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-204ENST00000403441 KLHL1Q9NR64 748 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-204ENST00000403441 SMYD2Q9NRG4 433 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-204ENST00000403441 TAS2R13Q9NYV9 303 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-204ENST00000403441 HCN3Q9P1Z3 774 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-204ENST00000403441 PCNX1Q96RV3 2341 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-204ENST00000403441 NPIPA5E9PKD4 350 aa11.63□□□□□ -0.55
PRAME-204ENST00000403441 H7BY64 318 aa11.63□□□□□ -0.55
PRAME-204ENST00000403441 ZBTB14O43829 449 aa11.63□□□□□ -0.55
PRAME-204ENST00000403441 URI1O94763 535 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
PRAME-204ENST00000403441 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
PRAME-204ENST00000403441 CLDN14O95500 239 aa11.63□□□□□ -0.55
PRAME-204ENST00000403441 STATHP02808 62 aa11.63□□□□□ -0.55
PRAME-204ENST00000403441 GSTA2P09210 222 aa11.63□□□□□ -0.55
PRAME-204ENST00000403441 IL1RNP18510 177 aa11.63□□□□□ -0.55
PRAME-204ENST00000403441 TAS2R50P59544 299 aa11.63□□□□□ -0.55
PRAME-204ENST00000403441 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
PRAME-204ENST00000403441 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
PRAME-204ENST00000403441 CUL1Q13616 776 aa11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.5 ms