RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399409.7

RABGGTA-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-202ENST00000399409 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
RABGGTA-202ENST00000399409 PROX2Q3B8N5 592 aa22.21■■□□□ 1.15
RABGGTA-202ENST00000399409 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa22.21■■□□□ 1.15
RABGGTA-202ENST00000399409 SYTL1Q8IYJ3 562 aa22.21■■□□□ 1.15
RABGGTA-202ENST00000399409 YIPF6Q96EC8 236 aa22.21■■□□□ 1.15
RABGGTA-202ENST00000399409 SGPP1Q9BX95 441 aa22.21■■□□□ 1.15
RABGGTA-202ENST00000399409 GABARAPL3Q9BY60 117 aa22.21■■□□□ 1.15
RABGGTA-202ENST00000399409 MTG2Q9H4K7 406 aa22.21■■□□□ 1.15
RABGGTA-202ENST00000399409 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa22.2■■□□□ 1.15
RABGGTA-202ENST00000399409 ACRP10323 421 aa22.2■■□□□ 1.15
RABGGTA-202ENST00000399409 ITGB8P26012 769 aa22.2■■□□□ 1.15
RABGGTA-202ENST00000399409 CRYBA2P53672 197 aa22.2■■□□□ 1.15
RABGGTA-202ENST00000399409 ERVFC1P60507 584 aa22.2■■□□□ 1.15
RABGGTA-202ENST00000399409 SELENOWP63302 87 aa22.2■■□□□ 1.15
RABGGTA-202ENST00000399409 RBBP4Q09028 425 aa22.2■■□□□ 1.15
RABGGTA-202ENST00000399409 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.15
RABGGTA-202ENST00000399409 NAGSQ8N159 534 aa22.2■■□□□ 1.15
RABGGTA-202ENST00000399409 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.15
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF540Q8NDQ6 660 aa22.2■■□□□ 1.15
RABGGTA-202ENST00000399409 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.15
RABGGTA-202ENST00000399409 RUBCNLQ9H714 662 aa22.2■■□□□ 1.15
RABGGTA-202ENST00000399409 SH3BGRLO75368 114 aa22.2■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 RFPL2O75678 378 aa22.2■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 CD6P30203 668 aa22.2■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 ST8SIA6P61647 398 aa22.2■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 RPP38P78345 283 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 GRIN2CQ14957 1233 aa22.2■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 PRSS48Q7RTY5 328 aa22.2■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF347Q96SE7 839 aa22.2■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 ITM2CQ9NQX7 267 aa22.2■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 HIDE1A8MVS5 230 aa22.19■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 ADAMDEC1O15204 470 aa22.19■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 NPPBP16860 134 aa22.19■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 FCHO2Q0JRZ9 810 aa22.19■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 NR1D2Q14995 579 aa22.19■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 TBC1D25Q3MII6 688 aa22.19■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 POM121L1PQ3SYA9 428 aa22.19■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 LAIR1Q6GTX8 287 aa22.19■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF765Q7L2R6 523 aa22.19■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 OR9A1PQ8NGU1 263 aa22.19■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 DMRT3Q9NQL9 472 aa22.19■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 MT-ND2P03891 347 aa22.19■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 NTRK1P04629 796 aa22.19■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 CISD3P0C7P0 127 aa22.19■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 DGKGP49619 791 aa22.19■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 ST13P50502 369 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
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RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF846Q147U1 533 aa22.19■■□□□ 1.14
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RABGGTA-202ENST00000399409 OR52N2Q8NGI0 321 aa22.19■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 HRASLS5Q96KN8 279 aa22.19■■□□□ 1.14
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RABGGTA-202ENST00000399409 CRATP43155 626 aa22.18■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 MAP2K4P45985 399 aa22.18■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 MLLT10P55197 1068 aa22.18■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 PDE7AQ13946 482 aa22.18■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF385BQ569K4 471 aa22.18■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 GCNT6Q5T4J0 391 aa22.18■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 PLPP4Q5VZY2 271 aa22.18■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 COMMD6Q7Z4G1 85 aa22.18■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 MAL2Q969L2 176 aa22.18■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 MTERF3Q96E29 417 aa22.18■■□□□ 1.14
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RABGGTA-202ENST00000399409 ITM2BQ9Y287 266 aa22.18■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 DOCK6Q96HP0 2047 aa22.18■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 TMEM229AB2RXF0 380 aa22.18■■□□□ 1.14
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RABGGTA-202ENST00000399409 TNFRSF21O75509 655 aa22.18■■□□□ 1.14
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RABGGTA-202ENST00000399409 RRM2P31350 389 aa22.18■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 CLCA4Q14CN2 919 aa22.18■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 DHCR24Q15392 516 aa22.18■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 CATSPEREQ5SY80 951 aa22.18■■□□□ 1.14
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RABGGTA-202ENST00000399409 DCDC5Q6ZRR9 648 aa22.18■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 P2RY8Q86VZ1 359 aa22.18■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 CHPT1Q8WUD6 406 aa22.18■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 UBE2E3Q969T4 207 aa22.18■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 PPCDCQ96CD2 204 aa22.18■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 VMP1Q96GC9 406 aa22.18■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 GULP1Q9UBP9 304 aa22.18■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 DGKBQ9Y6T7 804 aa22.18■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 PIPSLA2A3N6 862 aa22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 TRIM43BA6NCK2 446 aa22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 CLDN25C9JDP6 229 aa22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 GPR37L1O60883 481 aa22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 IRS1P35568 1242 aa22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 KRT20P35900 424 aa22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 MASP1P48740 699 aa22.17■■□□□ 1.14
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