RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384085.1

RNU6-38P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-38P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-38P-201ENST00000384085 GIFP27352 417 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 DUTP33316 252 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 SULT2A1Q06520 285 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 KRT80Q6KB66 452 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 VITQ6UXI7 678 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 ADCK1Q86TW2 530 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 GPD1LQ8N335 351 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR9Q2Q8NGE9 314 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 RHOXF1Q8NHV9 184 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 SEPT1Q8WYJ6 367 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 EXT2Q93063 718 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 CFAP57Q96MR6 1250 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 SPATA33Q96N06 139 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 POLLQ9UGP5 575 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP2.37□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 NEDD4P46934 1319 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 A0A087WWV3 80 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 TRIM49BA6NDI0 452 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF840PA6NDX5 716 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 ARHGEF33A8MVX0 844 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 F8VVB4 439 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 F8VWA3 439 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 GGPS1O95749 300 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 ADRB2P07550 413 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 SELEP16581 610 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 EDNRAP25101 427 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 KHKP50053 298 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 RIDAP52758 137 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 CLDN17P56750 224 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 BTG1P62324 171 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 MZT1Q08AG7 82 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 UPP1Q16831 310 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 RNF212Q495C1 297 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 REG3GQ6UW15 175 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 MACC1Q6ZN28 852 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 CROCCP3Q8IVE0 287 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZBED8Q8IZ13 594 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 PRSS35Q8N3Z0 413 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 C4orf32Q8N8J7 132 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 CAMKVQ8NCB2 501 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR6J1Q8NGC5 347 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC26A7Q8TE54 656 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 SSC4DQ8WTU2 575 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 CASP10Q92851 521 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF414Q96IQ9 312 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 LRRCC1Q9C099 1032 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 FZD8Q9H461 694 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 C3orf14Q9HBI5 128 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 TSPAN16Q9UKR8 245 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 AUP1Q9Y679 476 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 NKX6-3A6NJ46 265 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 TCP10L2B9ZVM9 353 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 H3BMM5 538 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF749O43361 778 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 KIF5CO60282 957 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 FYNP06241 537 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 CD59P13987 128 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 IL11P20809 199 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 RGS7P49802 495 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 SRPXP78539 464 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 LRRC73Q5JTD7 316 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 SUSD4Q5VX71 490 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 DHRS11Q6UWP2 260 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 C5orf24Q7Z6I8 188 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 NRARPQ7Z6K4 114 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 PRUNE1Q86TP1 453 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 FGFRL1Q8N441 504 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 CCDC185Q8N715 623 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR5M9Q8NGP3 310 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 RMDN1Q96DB5 314 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 CCDC28BQ9BUN5 200 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 KATNB1Q9BVA0 655 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 OCR1Q9BZK8 76 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 STRADBQ9C0K7 418 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 IL1RAPQ9NPH3 570 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 EXOC1Q9NV70 894 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 VSIG4Q9Y279 399 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMEM150CB9EJG8 249 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 E5RGE8 158 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 RNF103O00237 685 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 INPP4BO15327 924 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 TNFSF12O43508 249 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 PRAF2O60831 178 aa2.34□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms