RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 FUT10Q6P4F1 479 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ENPP6Q6UWR7 440 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP6.95□□□□□ -1.37e-7■■■■□ 22.4
CTPS1-201ENST00000372616 GDPD3Q7L5L3 318 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 SERPINA11Q86U17 422 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 PLCZ1Q86YW0 608 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 LIX1LQ8IVB5 337 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC28AQ8IWP9 274 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 IQCF2Q8IXL9 164 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 STK40Q8N2I9 435 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 TEX26Q8N6G2 289 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 CDYL2Q8N8U2 506 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 SPERTQ8NA61 448 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 DENND6BQ8NEG7 585 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 OR10A6Q8NH74 314 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 HASPINQ8TF76 798 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 SGCDQ92629 289 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 GTF2H4Q92759 462 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 RHBDF1Q96CC6 855 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 PCED1BQ96HM7 432 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 TEX37Q96LM6 180 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 TRIB3Q96RU7 358 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM246Q9BRR3 403 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 GABARAPL3Q9BY60 117 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 SLC22A4Q9H015 551 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 CLPBQ9H078 707 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 KCNH6Q9H252 994 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 REEP1Q9H902 201 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 SP110Q9HB58 689 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 IL37Q9NZH6 218 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 SLAMF8Q9P0V8 285 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 CACNG4Q9UBN1 327 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 GIMAP2Q9UG22 337 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 PKP3Q9Y446 797 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 MAU2Q9Y6X3 613 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 MYBPHLA2RUH7 354 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 PRR23AA6NEV1 266 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 B8ZZF3 427 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 C9JVG2 144 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 BTN3A1O00481 513 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 E2F3O00716 465 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ANKRD28O15084 1053 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 IRAK2O43187 625 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 BRINP1O60477 761 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 PGLSO95336 258 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 GOT2P00505 430 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 SERPINA1P01009 418 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 FABP3P05413 133 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ITGB1P05556 798 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 CDK1P06493 297 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 G6PDP11413 515 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 IL7P13232 177 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 EN2P19622 333 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 CD6P30203 668 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 FMO3P31513 532 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 PBX3P40426 434 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 PIK3CBP42338 1070 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 IL12RB1P42701 662 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 CHRNA4P43681 627 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 MAP2K4P45985 399 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 CLCN4P51793 760 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 RUNX1T1Q06455 604 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 SCN1BQ07699 218 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ANGPT1Q15389 498 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 CTXN3Q4LDR2 81 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 SIRPB2Q5JXA9 342 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 LRIF1Q5T3J3 769 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 MSANTD2Q6P1R3 559 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 IL27RAQ6UWB1 636 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 PAQR9Q6ZVX9 377 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC190Q86UF4 302 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 TAC4Q86UU9 113 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 PIM3Q86V86 326 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 CALHM3Q86XJ0 350 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 SNX29P2Q8IUI4 249 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ZZZ3Q8IYH5 903 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 GPR65Q8IYL9 337 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 FRS2Q8WU20 508 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 MYLPFQ96A32 169 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 TADA1Q96BN2 335 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 VWCEQ96DN2 955 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 C1orf159Q96HA4 380 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 HRASLS5Q96KN8 279 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF558Q96NG5 402 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 SERPINB11Q96P15 392 aa6.94□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms