RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368916.1

GABPB2-201, Transcript of GA binding protein transcription factor subunit beta 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene GABPB2, Length 1,680 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB2-201ENST00000368916 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 KCTD7Q96MP8 289 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 SPATA33Q96N06 139 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 QRFPRQ96P65 431 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 KCNS3Q9BQ31 491 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 DOHHQ9BU89 302 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 ULBP1Q9BZM6 244 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 B3GNT4Q9C0J1 378 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 SLC39A8Q9C0K1 460 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 ACTR6Q9GZN1 396 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 TMEM39BQ9GZU3 492 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 MINDY3Q9H8M7 445 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 THSD1Q9NS62 852 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 SLC39A1Q9NY26 324 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 COX16Q9P0S2 106 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 MUTYHQ9UIF7 546 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 ZNF112Q9UJU3 913 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 DUSP12Q9UNI6 340 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 AKT3Q9Y243 479 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 CCL27Q9Y4X3 112 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 SNX8Q9Y5X2 465 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 MGAMO43451 1857 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 SCN9AQ15858 1988 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 C9JVG2 144 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 TRIM77I1YAP6 450 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 TNFRSF11BO00300 401 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 PPP6CO00743 305 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 KPNA5O15131 536 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 LYRM1O43325 122 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 CCNB2O95067 398 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 STSP08842 583 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 IQCF3P0C7M6 154 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 HSMCR30P0CW71 290 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 ANXA3P12429 323 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 CYP4B1P13584 511 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 ARSAP15289 507 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 ARSBP15848 533 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 RHOQP17081 205 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 PTPRAP18433 802 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 RAB3AP20336 220 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 LHCGRP22888 699 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 RPS19P39019 145 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 PTGER3P43115 390 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 KIR2DL3P43628 341 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 DGKQP52824 942 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 DAB2P98082 770 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 TTLL4Q14679 1199 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 TSTQ16762 297 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 DUOXA1Q1HG43 343 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 MICAQ29983 383 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 GGTA1PQ4G0N0 100 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 PYDC2Q56P42 97 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 TMEM201Q5SNT2 666 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 SLC25A30Q5SVS4 291 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 PAQR3Q6TCH7 311 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 KLHL17Q6TDP4 642 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 CEP68Q76N32 757 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 RRM2BQ7LG56 351 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 C16orf62Q7Z3J2 963 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 C9orf62Q8N4C0 152 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 UBTD2Q8WUN7 234 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 USP7Q93009 1102 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 TBATAQ96M53 351 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 PGLYRP2Q96PD5 576 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 SORCS2Q96PQ0 1159 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 OR2M2Q96R28 347 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 KCNJ15Q99712 375 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 DPYSL5Q9BPU6 564 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 TBCDQ9BTW9 1192 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 GSX2Q9BZM3 304 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 TRIM8Q9BZR9 551 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 RDH14Q9HBH5 336 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 LTB4R2Q9NPC1 389 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 FZD3Q9NPG1 666 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 GIMAP2Q9UG22 337 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 NDOR1Q9UHB4 597 aa7.19□□□□□ -1.26
GABPB2-201ENST00000368916 KLF15Q9UIH9 416 aa7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms