RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 FAM47BQ8NA70 645 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 TSSK3Q96PN8 268 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PAFAH2Q99487 392 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 APMAPQ9HDC9 416 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SDHAF3Q9NRP4 125 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF446Q9NWS9 450 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CAMK2AQ9UQM7 478 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 THADAQ6YHU6 1953 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 LTBP2Q14767 1821 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 NPIPA2E9PIF3 369 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 NPIPA3F8WFD2 350 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 RGS14O43566 566 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CDH16O75309 829 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ZFAND5O76080 213 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SLC16A8O95907 504 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 GBAP04062 536 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CD82P27701 267 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 HPCAL1P37235 193 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SLC1A2P43004 574 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CYB561P49447 251 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 IL11RAQ14626 422 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 C4orf17Q53FE4 359 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SULT1C3Q6IMI6 304 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 RNF111Q6ZNA4 994 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 KIAA0408Q6ZU52 694 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 FJX1Q86VR8 437 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 FAM9CQ8IZT9 166 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 NAGSQ8N159 534 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 TRIML2Q8N7C3 387 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 NAT8LQ8N9F0 302 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 OR4D9Q8NGE8 314 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 FBXO30Q8TB52 745 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 XAGE5Q8WWM1 108 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PPCDCQ96CD2 204 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SFXN2Q96NB2 322 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SLC6A16Q9GZN6 736 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 IL1RL2Q9HB29 575 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 NINJ2Q9NZG7 142 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 DCDC2Q9UHG0 476 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PHF11Q9UIL8 331 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ANKRD12Q6UB98 2062 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1B0GX78 115 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 FAM90A27PA6NNH2 459 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 RIPK2O43353 540 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SCO2O43819 266 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 GLRA3O75311 464 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SASH3O75995 380 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CLDN9O95484 217 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PRLP01236 227 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 GSTM1P09488 218 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 GDF1P27539 372 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 FEN1P39748 380 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CAPZBP47756 277 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SESN3P58005 492 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PFN3P60673 137 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PPP2R2AP63151 447 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 GSTM4Q03013 218 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 HEPACAMQ14CZ8 416 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 STK32CQ86UX6 486 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 NUDT13Q86X67 352 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 DEPDC4Q8N2C3 294 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 GALNT16Q8N428 558 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ARRDC2Q8TBH0 407 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 STT3BQ8TCJ2 826 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SDCCAG3Q96C92 435 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF354BQ96LW1 612 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SLC25A18Q9H1K4 315 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 DEFB127Q9H1M4 99 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ACTL8Q9H568 366 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 LHX9Q9NQ69 397 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ATAD3AQ9NVI7 634 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 MOCS1Q9NZB8 636 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ALPK3Q96L96 1907 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 MYO16Q9Y6X6 1858 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 FAM166BA8MTA8 275 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 IDSB3KWA1 339 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ANGPT2O15123 496 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SPINT1O43278 529 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CREG1O75629 220 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 TP53P04637 393 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 HIST1H2ABP04908 130 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 NR2F1P10589 423 aa4.25□□□□□ -1.73
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