RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348333.7

TNFRSF25-201, Transcript of TNF receptor superfamily member 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFRSF25, Length 1,119 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25-201ENST00000348333 PEX11GQ96HA9 241 aa21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF25-201ENST00000348333 LMF1Q96S06 567 aa21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF25-201ENST00000348333 ERP44Q9BS26 406 aa21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF25-201ENST00000348333 SARGQ9BW04 601 aa21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF25-201ENST00000348333 RHOJQ9H4E5 214 aa21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF25-201ENST00000348333 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF25-201ENST00000348333 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLC22A14Q9Y267 594 aa21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF25-201ENST00000348333 ANKUB1A6NFN9 424 aa21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 C4orf51C9J302 202 aa21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 GMPRP36959 345 aa21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 REEP5Q00765 189 aa21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 TLR1Q15399 786 aa21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 TRADDQ15628 312 aa21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 ANKRD37Q7Z713 158 aa21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 TMPRSS11BQ86T26 416 aa21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 AICDAQ9GZX7 198 aa21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 LANCL2Q9NS86 450 aa21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 WHRNQ9P202 907 aa21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLC22A7Q9Y694 548 aa21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 FAM187AA6NFU0 413 aa21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 C1QAP02745 245 aa21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 GDF5P43026 501 aa21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 SCTRP47872 440 aa21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 ST13P50502 369 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 ARG2P78540 354 aa21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 CSHL1Q14406 222 aa21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 DEFB134Q4QY38 66 aa21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 OR1N1Q8NGS0 311 aa21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 PYROXD1Q8WU10 500 aa21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 METTL21AQ8WXB1 218 aa21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 TSLPQ969D9 159 aa21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 OARD1Q9Y530 152 aa21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 CROCCQ5TZA2 2017 aa21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 A1L4Q6 167 aa21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 WFS1O76024 890 aa21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 HNF4AP41235 474 aa21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 GPX6P59796 221 aa21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 RHAGQ02094 409 aa21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 HYAL2Q12891 473 aa21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 FBXO48Q5FWF7 155 aa21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 FCRLBQ6BAA4 426 aa21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 BBOF1Q8ND07 529 aa21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 NT5CQ8TCD5 201 aa21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 EGFL8Q99944 293 aa21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 TUBB6Q9BUF5 446 aa21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 KLHL31Q9H511 634 aa21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 GPAMQ9HCL2 828 aa21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZFP69BQ9UJL9 534 aa21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 DYRK1BQ9Y463 629 aa21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 PCDH17O14917 1159 aa21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 WDPCPO95876 746 aa21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 UQCRHP07919 91 aa21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 ALOX12P18054 663 aa21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 TNFSF10P50591 281 aa21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 RAB8AP61006 207 aa21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 CALCOCO2Q13137 446 aa21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 NXPE4Q6UWF7 544 aa21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 SYT10Q6XYQ8 523 aa21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 TAAR6Q96RI8 345 aa21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 FAM129AQ9BZQ8 928 aa21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 PELI2Q9HAT8 420 aa21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 CHST10O43529 356 aa21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 WDR47O94967 919 aa21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLC6A12P48065 614 aa21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 CDKL1Q00532 357 aa21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 PWP1Q13610 501 aa21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 ABRAXAS2Q15018 415 aa21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 HERC3Q15034 1050 aa21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 BTBD16Q32M84 506 aa21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 FAR1Q8WVX9 515 aa21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 ANKRD7Q92527 254 aa21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 HAS2Q92819 552 aa21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 RHBDF1Q96CC6 855 aa21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 TMEM79Q9BSE2 394 aa21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLC6A16Q9GZN6 736 aa21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 POPDC3Q9HBV1 291 aa21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 POLEQ07864 2286 aa21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 DYTNA2CJ06 578 aa21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF25-201ENST00000348333 FAM159BA6NKW6 160 aa21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.5 ms