RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321027.7

GCFC2-201, Transcript of GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GCFC2, Length 4,440 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2-201ENST00000321027 KELP23276 732 aa14.9□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 TSTQ16762 297 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 MINDY4Q4G0A6 757 aa14.9□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 ATAT1Q5SQI0 421 aa14.9□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 CCDC80Q76M96 950 aa14.9□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 GAL3ST1Q99999 423 aa14.9□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 KCNC1P48547 511 aa14.9□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 CLCN4P51793 760 aa14.9□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 TEAD2Q15562 447 aa14.9□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 UAP1L1Q3KQV9 507 aa14.9□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 LY6G5CQ5SRR4 150 aa14.9□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 SUSD1Q6UWL2 747 aa14.9□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 BTN2A1Q7KYR7 527 aa14.9□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 SNX33Q8WV41 574 aa14.9□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 RDH12Q96NR8 316 aa14.9□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 KCNH6Q9H252 994 aa14.9□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa14.9□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 UBR3Q6ZT12 1888 aa14.9□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 SLC1A7O00341 560 aa14.9□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 ACOX3O15254 700 aa14.9□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 APODP05090 189 aa14.9□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 STARP49675 285 aa14.9□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 RPS13P62277 151 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 RPP38P78345 283 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 VMACQ2NL98 169 aa14.9□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa14.9□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 HCSTQ9UBK5 93 aa14.9□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 AASSQ9UDR5 926 aa14.9□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 RREB1Q92766 1687 aa14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 PITPNM1O00562 1244 aa14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 AGXTP21549 392 aa14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 SDC2P34741 201 aa14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 DPP6P42658 865 aa14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 TM4SF4P48230 202 aa14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 RCAN2Q14206 197 aa14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 COQ5Q5HYK3 327 aa14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 NPAS3Q8IXF0 933 aa14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 CPA6Q8N4T0 437 aa14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 GOLM1Q8NBJ4 401 aa14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 PIGKQ92643 395 aa14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 LGALS12Q96DT0 336 aa14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 CMTM7Q96FZ5 175 aa14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 ADAP2Q9NPF8 381 aa14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 FABP12A6NFH5 140 aa14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 LSM1O15116 133 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 TEX28O15482 410 aa14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 STATHP02808 62 aa14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 NCS1P62166 190 aa14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 CES4AQ5XG92 561 aa14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 ATG9BQ674R7 924 aa14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 BEND5Q7L4P6 421 aa14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 OAFQ86UD1 273 aa14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 AQP11Q8NBQ7 271 aa14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 KCT2Q8NC54 265 aa14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 CD200R1Q8TD46 325 aa14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 C5orf34Q96MH7 638 aa14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 CFL2Q9Y281 166 aa14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 LEFTY2O00292 366 aa14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 ACOT8O14734 319 aa14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 PI15O43692 258 aa14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 ADAMTS4O75173 837 aa14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 TYRP14679 529 aa14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 GGT1P19440 569 aa14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 TAS2R50P59544 299 aa14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 RAB41Q5JT25 222 aa14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 NIPAL1Q6NVV3 410 aa14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 FAM129CQ86XR2 697 aa14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 GAB3Q8WWW8 586 aa14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 NT5C3BQ969T7 300 aa14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 ZFP3Q96NJ6 502 aa14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 ATOH8Q96SQ7 321 aa14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 TMED5Q9Y3A6 229 aa14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 RWDD3Q9Y3V2 267 aa14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 GPR45Q9Y5Y3 372 aa14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 VILLO15195 856 aa14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 MPZL2O60487 215 aa14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 C6orf47O95873 294 aa14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 TIE1P35590 1138 aa14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 HMGCLP35914 325 aa14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 BMXP51813 675 aa14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 C6orf183Q5T699 404 aa14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 FOXB2Q5VYV0 432 aa14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 FAM92BQ6ZTR7 304 aa14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 GALNT13Q8IUC8 556 aa14.89□□□□□ -0.03
GCFC2-201ENST00000321027 LCN9Q8WX39 176 aa14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms