RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 FASP25445 335 aa21.8■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 TAS2R50P59544 299 aa21.8■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 Q6ZSR6 202 aa21.8■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 ANKFN1Q8N957 763 aa21.8■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 TNIP2Q8NFZ5 429 aa21.8■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 SLC29A1Q99808 456 aa21.8■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 ATP6V1HQ9UI12 483 aa21.8■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 MAPRE3Q9UPY8 281 aa21.8■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 C10orf142B7Z368 130 aa21.8■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 CLIC1O00299 241 aa21.8■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 RTCAO00442 366 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 CXCR6O00574 342 aa21.8■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 ENGP17813 658 aa21.8■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 ACTR1BP42025 376 aa21.8■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 DGKEP52429 567 aa21.8■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 SRP54P61011 504 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 ACTR1AP61163 376 aa21.8■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 C2orf80Q0P641 193 aa21.8■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 ALG11Q2TAA5 492 aa21.8■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 DEPDC1Q5TB30 811 aa21.8■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF852Q6ZMS4 543 aa21.8■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 SPHK1Q9NYA1 384 aa21.8■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 ADGRE2Q9UHX3 823 aa21.8■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa21.79■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 ARHGAP10A1A4S6 786 aa21.79■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 FURINP09958 794 aa21.79■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 PRKCQQ04759 706 aa21.79■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 FAM86B1Q8N7N1 296 aa21.79■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 FRMD1Q8N878 549 aa21.79■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 RNF145Q96MT1 663 aa21.79■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa21.79■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa21.79■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 MAN2B1O00754 1011 aa21.78■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 EPN2O95208 641 aa21.78■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 YPEL5P62699 121 aa21.78■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 ABHD18Q0P651 414 aa21.78■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 MED21Q13503 144 aa21.78■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 FAM71E1Q6IPT2 247 aa21.78■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 VPS37AQ8NEZ2 397 aa21.78■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 OR13H1Q8NG92 308 aa21.78■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 GATA6Q92908 595 aa21.78■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 CHID1Q9BWS9 393 aa21.78■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 VCXQ9H320 206 aa21.78■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa21.78■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 NT5DC2Q9H857 520 aa21.78■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 MYNNQ9NPC7 610 aa21.78■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 BTNL2Q9UIR0 455 aa21.78■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 SAC3D1A6NKF1 404 aa21.78■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 EVPLLA8MZ36 301 aa21.78■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 TNFRSF10CO14798 259 aa21.78■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 ANXA8L1Q5VT79 327 aa21.78■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 MMP21Q8N119 569 aa21.78■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 CLEC4FQ8N1N0 589 aa21.78■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 FBXO30Q8TB52 745 aa21.78■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 FAM162AQ96A26 154 aa21.78■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 CXorf40BQ96DE9 158 aa21.78■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 LMAN1LQ9HAT1 526 aa21.78■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 SLC6A20Q9NP91 592 aa21.78■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa21.78■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 AXIN1O15169 862 aa21.77■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 IGLV3-19P01714 112 aa21.77■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 IL3P08700 152 aa21.77■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 BLMHQ13867 455 aa21.77■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 PDE7AQ13946 482 aa21.77■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 GAS6Q14393 721 aa21.77■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 PRSS53Q2L4Q9 553 aa21.77■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa21.77■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 ENPP6Q6UWR7 440 aa21.77■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 SYT13Q7L8C5 426 aa21.77■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa21.77■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF687Q8N1G0 1237 aa21.77■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 FBXL6Q8N531 539 aa21.77■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 OR4E2Q8NGC2 313 aa21.77■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 NCLNQ969V3 563 aa21.77■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 AHSPQ9NZD4 102 aa21.77■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 SPASTQ9UBP0 616 aa21.77■■□□□ 1.08
VSTM4-201ENST00000298454 C7orf72A4D263 438 aa21.77■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 SCELO95171 688 aa21.77■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 MPEG1Q2M385 716 aa21.77■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 KIAA0895LQ68EN5 471 aa21.77■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 WASH2PQ6VEQ5 465 aa21.77■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 EPHX4Q8IUS5 362 aa21.77■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 NETO1Q8TDF5 533 aa21.77■■□□□ 1.07
VSTM4-201ENST00000298454 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms