RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292535.11

CUX1-201, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CUX1, Length 13,747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-201ENST00000292535 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 ENGP17813 658 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 AQP11Q8NBQ7 271 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 TAMM41Q96BW9 452 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 IFNA5P01569 189 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 ZNF35P13682 527 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 IFNGR1P15260 489 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 RFC2P35250 354 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 NRIP1P48552 1158 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 GBE1Q04446 702 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 MALLQ13021 153 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 ADGRF1Q5T601 910 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 IRF5Q13568 498 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 UAP1L1Q3KQV9 507 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 PPM1JQ5JR12 505 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 ZNF584Q8IVC4 421 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 FCAMRQ8WWV6 532 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 TMEM109Q9BVC6 243 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 SUV39H2Q9H5I1 410 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 DHDHQ9UQ10 334 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 NMBRP28336 390 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 SLC6A6P31641 620 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 CEACAM20Q6UY09 585 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 TMED4Q7Z7H5 227 aa9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 HSBP1L1C9JCN9 74 aa9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 UGT1A1P22309 533 aa9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 ZNF460Q14592 562 aa9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 LRRC66Q68CR7 880 aa9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 REEP3Q6NUK4 255 aa9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 LRRN1Q6UXK5 716 aa9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 SLC36A4Q6YBV0 504 aa9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 C22orf15Q8WYQ4 148 aa9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 ETS2P15036 469 aa9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 PHC1P78364 1004 aa9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 LHFPL3Q86UP9 236 aa9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 DMRTB1Q96MA1 342 aa9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 CLDND1Q9NY35 253 aa9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 GPR37L1O60883 481 aa9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 MAGP20916 626 aa9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 MATN1P21941 496 aa9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 NFE2L1Q14494 772 aa9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP9.05□□□□□ -0.965e-6■■■■□ 20.8
CUX1-201ENST00000292535 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 PKP4Q99569 1192 aa9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 ZFP57Q9NU63 452 aa9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 TAS2R10Q9NYW0 307 aa9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 GHRLQ9UBU3 117 aa9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 K7EPI3 171 aa9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 LILRA4P59901 499 aa9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 GLIS3Q8NEA6 775 aa9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 SPEF2Q9C093 1822 aa9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 A0A1W2PRU2 124 aa9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 NPIPA2E9PIF3 369 aa9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 NPIPA3F8WFD2 350 aa9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 MZT1Q08AG7 82 aa9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 GRIK2Q13002 908 aa9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 ELOCQ15369 112 aa9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 MAPK15Q8TD08 544 aa9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 IRF7Q92985 503 aa9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 TMEM209Q96SK2 561 aa9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 TM9SF2Q99805 663 aa9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 MALT1Q9UDY8 824 aa9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 ATRNO75882 1429 aa9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 YES1P07947 543 aa9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 CHRFAM7AQ494W8 412 aa9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 ZNF781Q8N8C0 355 aa9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 CD99L2Q8TCZ2 262 aa9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 A0A1W2PRQ8 180 aa9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 ZNF100Q8IYN0 542 aa9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 TMEM234Q8WY98 164 aa9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 PADI3Q9ULW8 664 aa9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 SAP18O00422 153 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 TMEM225Q6GV28 225 aa9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 PROKR1Q8TCW9 393 aa9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 SMARCD2Q92925 531 aa9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 DUX1O43812 170 aa9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 UGT2B10P36537 528 aa9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 MAB21L1Q13394 359 aa9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 ASB9Q96DX5 294 aa9.05□□□□□ -0.96
CUX1-201ENST00000292535 ADAP2Q9NPF8 381 aa9.05□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms