RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 HPRP00739 348 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 PRH1P02810 166 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 JAG1P78504 1218 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 ARFRP1Q13795 201 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 SCGB3A2Q96PL1 93 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 TRIB3Q96RU7 358 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 TMED9Q9BVK6 235 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM5Q9Y2B1 443 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 C5orf51A6NDU8 294 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 SLC36A4Q6YBV0 504 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 TXNRD2Q9NNW7 524 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 CD1DP15813 335 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 CRHR2Q13324 411 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 MAPK14Q16539 360 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 GFOD2Q3B7J2 385 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 GOLM1Q8NBJ4 401 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 HSPBAP1Q96EW2 488 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 B3GNT4Q9C0J1 378 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 REEP4Q9H6H4 257 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF304Q9HCX3 659 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 A0A096LPI6 279 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 RING1Q06587 406 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF792Q3KQV3 632 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM135Q86UB9 458 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 IFNL1Q8IU54 200 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 MEAF6Q9HAF1 191 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 NLGN3Q9NZ94 848 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 B4GALT6Q9UBX8 382 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 ERVK-11Q9UQG0 969 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 OR2AT4A6NND4 320 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 SLC11A1P49279 550 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 PPP1R3AQ16821 1122 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 LIPJQ5W064 366 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 ALKBH2Q6NS38 261 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 OSTF1Q92882 214 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 SYT17Q9BSW7 474 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 UBR1Q8IWV7 1749 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 TRAM2Q15035 370 aa20.45■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 CNKSR3Q6P9H4 555 aa20.45■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 ISOC1Q96CN7 298 aa20.45■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 SIPA1Q96FS4 1042 aa20.45■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 CYTH4Q9UIA0 394 aa20.45■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 PSMD9O00233 223 aa20.45■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 KCNAB2Q13303 367 aa20.45■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 ANKDD1AQ495B1 522 aa20.45■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 GHDCQ8N2G8 530 aa20.45■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 THRSPQ92748 146 aa20.45■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 MUS81Q96NY9 551 aa20.45■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 RANBP9Q96S59 729 aa20.45■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 DPYSL5Q9BPU6 564 aa20.45■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 MAU2Q9Y6X3 613 aa20.45■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 NFKBIEO00221 500 aa20.45■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 DLGAP1O14490 977 aa20.45■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 CLCN2P51788 898 aa20.45■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 C14orf80Q86SX3 495 aa20.45■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 RNF130Q86XS8 419 aa20.45■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 MARVELD2Q8N4S9 558 aa20.45■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 INSL6Q9Y581 213 aa20.45■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF726A6NNF4 738 aa20.45■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 H0YJX3 145 aa20.45■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF208O43345 1280 aa20.45■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 AOC2O75106 756 aa20.45■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 NR2C1P13056 603 aa20.45■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 MATN1P21941 496 aa20.45■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 AGTR2P50052 363 aa20.45■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF45Q02386 682 aa20.45■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 SLC3A1Q07837 685 aa20.45■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 NFATC2Q13469 925 aa20.45■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 C2orf27AQ580R0 203 aa20.45■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 ADAMTS10Q9H324 1103 aa20.45■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 TBCCD1Q9NVR7 557 aa20.45■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 J3QLW9 94 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 RASAL1O95294 804 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 PGAM2P15259 253 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF19P17023 458 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 PTPRCAPQ14761 206 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 NOXRED1Q6NXP6 359 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 SYCE2Q6PIF2 218 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 YIPF7Q8N8F6 280 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 CMAHPQ9Y471 501 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 FUT4P22083 530 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 HOXC12P31275 282 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 ARPC4P59998 168 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 TLE2Q04725 743 aa20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms