RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 ART1P52961 327 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 SEL1L2Q5TEA6 688 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 REXO1L1PQ8IX06 675 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 CACNA1CQ13936 2221 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 ADAM10O14672 748 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 TPOP07202 933 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 USP10Q14694 798 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 TTLL9Q3SXZ7 439 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 CEP128Q6ZU80 1094 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 VN1R4Q7Z5H5 301 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 MFSD3Q96ES6 412 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 POM121Q96HA1 1249 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 PANX2Q96RD6 677 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 PTGER1P34995 402 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 NPY2RP49146 381 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 OR4D2P58180 307 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 BASP1P80723 227 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 TYSND1Q2T9J0 566 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 CD163Q86VB7 1156 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 ACBD4Q8NC06 268 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 TSLPQ969D9 159 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 ASB1Q9Y576 335 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM90A27PA6NNH2 459 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 TFECO14948 347 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 KIF5CO60282 957 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 NME2P1O60361 137 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 NME2P22392 152 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 MGAT1P26572 445 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 ARNTP27540 789 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC26A5P58743 744 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 CUL1Q13616 776 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 RNFT1Q5M7Z0 435 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 RAD9BQ6WBX8 426 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 FGD2Q7Z6J4 655 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM200AQ86VY9 491 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 LGI4Q8N135 537 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 CAMKVQ8NCB2 501 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM125Q96AQ2 219 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 PEX11GQ96HA9 241 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 TCF12Q99081 682 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 OLFM1Q99784 485 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM184CQ9NVA4 438 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 SYBUQ9NX95 663 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF860A6NHJ4 632 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 RPL22P35268 128 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 PTGS2P35354 604 aa25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 AP3B1O00203 1094 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 ZBTB14O43829 449 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 HRH2P25021 359 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 CYB561P49447 251 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 RHAGQ02094 409 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 CYP4X1Q8N118 509 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 KIF2BQ8N4N8 673 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 KCT2Q8NC54 265 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 ASB5Q8WWX0 329 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 THAP11Q96EK4 314 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC30A3Q99726 388 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa25.7■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1B0GTH9 108 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 NKX2-6A6NCS4 301 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 FOXO6A8MYZ6 492 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 OGNP20774 298 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 IMPA1P29218 277 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 RFC3P40938 356 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 ADARP55265 1226 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 ASPGQ86U10 573 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 PDSS2Q86YH6 399 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 PRELID2Q8N945 189 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 PLPP5Q8NEB5 264 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM57AQ8TBR7 257 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 HES6Q96HZ4 224 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF559Q9BR84 538 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 KIFC1Q9BW19 673 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa25.69■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 FEZF1A0PJY2 475 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 MAGEB17A8MXT2 336 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 PTMSP20962 102 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 COILP38432 576 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 MEOX1P50221 254 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 CLCN7P51798 805 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 ITGA8P53708 1063 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 KIF5AQ12840 1032 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM211Q6ICI0 200 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 PCGF5Q86SE9 256 aa25.68■■□□□ 1.7
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
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