RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625672.2

NRXN1-222, Transcript of neurexin 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene NRXN1, Length 8,113 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NRXN1-222	ENST00000625672	MSL3P1	P0C860	447 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	PTN	P21246	168 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	SLC6A4	P31645	630 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	ABRAXAS2	Q15018	415 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	TMEM214	Q6NUQ4	689 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	SLURP2	P0DP57	97 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	PON3	Q15166	354 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	TMEM203	Q969S6	136 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	EFCAB11	Q9BUY7	163 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	FSCN2	O14926	492 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	IFNA2	P01563	188 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	HLA-E	P13747	358 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	PRPS1L1	P21108	318 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	BLMH	Q13867	455 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	TIGD6	Q17RP2	521 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	THOC6	Q86W42	341 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	NATD1	Q8N6N6	113 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	TGM7	Q96PF1	710 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	RAB21	Q9UL25	225 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	ACOT7	O00154	380 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	HAS3	O00219	553 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	NIPSNAP2	O75323	286 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	ENG	P17813	658 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	RAB8A	P61006	207 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	TFG	Q92734	400 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	KAZALD1	Q96I82	304 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	RAB26	Q9ULW5	256 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	SPARC	P09486	303 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	ANXA3	P12429	323 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	CCL14	Q16627	93 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	GPR33	Q49SQ1	333 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	NFKBID	Q8NI38	313 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	HRASLS2	Q9NWW9	162 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	BCL9	O00512	1426 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	TLR4	O00206	839 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	LRCH4	O75427	683 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	LYSMD3	Q7Z3D4	306 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	SMPDL3A	Q92484	453 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	KCNN3	Q9UGI6	736 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	ICK	Q9UPZ9	632 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	PMS2P3	Q13401	168 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	OR13C4	Q8NGS5	318 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	OR8S1	Q8NH09	359 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	DEFB126	Q9BYW3	111 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	DISC1	C4P0D8	188 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	FBP2	O00757	339 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	FGF18	O76093	207 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	ECM1	Q16610	540 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	TMEM234	Q8WY98	164 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	PTPRM	P28827	1452 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	ZNF12	P17014	697 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	CDKN2B	P42772	138 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	MON1B	Q7L1V2	547 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	GATS	Q8NAP1	163 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	FRS2	Q8WU20	508 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	DUX1	O43812	170 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	CREB5	Q02930	508 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	RHEB	Q15382	184 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	DNTTIP1	Q9H147	329 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	PRTFDC1	Q9NRG1	225 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	C2orf74	A8MZ97	194 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	GSTM3	P21266	225 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	MYLK3	Q32MK0	819 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	C1orf52	Q8N6N3	182 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	TBC1D15	Q8TC07	691 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		13.46	□□□□□ -0.25

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