RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620099.1

SNORD39.4-201, humanhuman

BASIC

Gene SNORD39, Length 78 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD39.4-201ENST00000620099 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 SEMA5BQ9P283 1151 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 ADAM21Q9UKJ8 722 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 CDH7Q9ULB5 785 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 TTLL3Q9Y4R7 772 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 NUP210LQ5VU65 1888 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 TSPAN11A1L157 253 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 RGSL1A5PLK6 1076 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 ANKRD66B4E2M5 251 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 WASH3PC4AMC7 463 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 H3BQF6 201 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 H7C1Q1 480 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 J3KR12 359 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 PSMD11O00231 422 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 CLIC1O00299 241 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 MGST3O14880 152 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 TSPAN3O60637 253 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 MOSPD3O75425 235 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 ECI2O75521 394 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 RFPL2O75678 378 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 POP4O95707 220 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 IL1BP01584 269 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 IGLV2-14P01704 120 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 MT-ND3P03897 115 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 SHBGP04278 402 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 MMP2P08253 660 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 GLULP15104 373 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 CEBPBP17676 345 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 PSMC3P17980 439 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 CD53P19397 219 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 DRD4P21917 467 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 CD9P21926 228 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 SSTR1P30872 391 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 GALNSP34059 522 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 HMGCLP35914 325 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 PLA2G5P39877 138 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 SLC26A3P40879 764 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 MDH1P40925 334 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 CSKP41240 450 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 CCR2P41597 374 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 CD86P42081 329 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 TTPAP49638 278 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 CLCN5P51795 746 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 LIMK2P53671 638 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 ADARP55265 1226 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 GPX6P59796 221 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 DCDC1P59894 354 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 RPL15P61313 204 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 ECT2LQ008S8 904 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 IL9RQ01113 521 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 BCL2L1Q07817 233 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 ITGA9Q13797 1035 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 CNGA3Q16281 694 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 CCDC153Q494R4 210 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 TTMPQ5BVD1 217 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 TSTD2Q5T7W7 516 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 ARMC12Q5T9G4 340 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 KLC3Q6P597 504 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 AFTPHQ6ULP2 937 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 RGS9BPQ6ZS82 235 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 SYT13Q7L8C5 426 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 LRRTM4Q86VH4 590 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 MFSD6LQ8IWD5 586 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 CTAGE3PQ8IX95 158 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 NAXEQ8NCW5 288 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 ARRDC2Q8TBH0 407 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 RDH11Q8TC12 318 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 GDPD5Q8WTR4 605 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 DCAKDQ8WVC6 231 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 DNASE1L2Q92874 299 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 FGF13Q92913 245 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 RMDN1Q96DB5 314 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 CCDC126Q96EE4 140 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 ALG14Q96F25 216 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 CFAP36Q96G28 342 aa3.35□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms