RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620055.4

CCL4L2-215, Transcript of C-C motif chemokine ligand 4 like 2, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL4L2, Length 537 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCL4L2-215	ENST00000620055	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	TAC4	Q86UU9	113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	GALNT16	Q8N428	558 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055		Q8N9G6	341 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	FAR1	Q8WVX9	515 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	NAT6	Q93015	286 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	KLHL29	Q96CT2	875 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	ALG14	Q96F25	216 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	SERPINB11	Q96P15	392 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	LRRC61	Q9BV99	259 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	LRRN3	Q9H3W5	708 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	CUEDC2	Q9H467	287 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	DYRK4	Q9NR20	520 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	RAB20	Q9NX57	234 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	COX16	Q9P0S2	106 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	ANAPC2	Q9UJX6	822 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	IGLON5	A6NGN9	336 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055		D6RAR5	112 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	TMX2-CTNND1	H3BSU7	103 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055		O00370	1275 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	PDXK	O00764	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	ALOX15B	O15296	676 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	KLRC4	O43908	158 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	NEURL1	O76050	574 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	SEC14L2	O76054	403 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	ADA	P00813	363 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	IL1A	P01583	271 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	APOE	P02649	317 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	KRT7	P08729	469 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	RNF224	P0DH78	156 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	VDR	P11473	427 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	CCL4	P13236	92 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	NR1D1	P20393	614 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	RRM1	P23921	792 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	NR2F2	P24468	414 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	FMO4	P31512	558 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	CCKBR	P32239	447 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	ARL3	P36405	182 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	PTPN9	P43378	593 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	UQCRFS1	P47985	274 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	THOP1	P52888	689 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	RPS21	P63220	83 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	PMPCA	Q10713	525 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	PRKG2	Q13237	762 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	SGCG	Q13326	291 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	CUL2	Q13617	745 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	KRT39	Q6A163	491 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	FBXL22	Q6P050	247 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	AAGAB	Q6PD74	315 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	LINGO4	Q6UY18	593 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	SFTPA2	Q8IWL1	248 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	TTC39C	Q8N584	583 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	PLD5	Q8N7P1	536 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	C9orf43	Q8TAL5	461 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	TSACC	Q96A04	125 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	MIB2	Q96AX9	1013 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	FEM1C	Q96JP0	617 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	FEM1A	Q9BSK4	669 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	ADNP	Q9H2P0	1102 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	NLK	Q9UBE8	527 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	IL36A	Q9UHA7	158 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	VPS28	Q9UK41	221 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	ITM2B	Q9Y287	266 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	RNF215	Q9Y6U7	377 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	RELN	P78509	3460 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	FLNC	Q14315	2725 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	TRPM6	Q9BX84	2022 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63

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