RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 M1APQ8TC57 530 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC138Q96M89 665 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 PHF12Q96QT6 1004 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 NPAS2Q99743 824 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 ANKHQ9HCJ1 492 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 FBXO5Q9UKT4 447 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 SH2B3Q9UQQ2 575 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 SCN3AQ9NY46 2000 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 GOLGA8MH3BSY2 632 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 HAUS5O94927 633 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 COILP38432 576 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 CD96P40200 585 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 MAGEA3P43357 314 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 CASP6P55212 293 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 MPP1Q00013 466 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 MEP1AQ16819 746 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 PDSS2Q86YH6 399 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 CRLF3Q8IUI8 442 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP23.49■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 TRIM58Q8NG06 486 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 CALML6Q8TD86 181 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 FAM129AQ9BZQ8 928 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 MMP25Q9NPA2 562 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 PDE10AQ9Y233 779 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 POLQO75417 2590 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 FEZF1A0PJY2 475 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 TTI1O43156 1089 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 RDH16O75452 317 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 C3AR1Q16581 482 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 XKRXQ6PP77 449 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 ASPGQ86U10 573 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 SLC26A11Q86WA9 606 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 C17orf64Q86WR6 236 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 PLPP5Q8NEB5 264 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 SLC13A3Q8WWT9 602 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 SLC22A7Q9Y694 548 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC175P0C221 793 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 ADORA2A-AS1P86434 159 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP23.47■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 RHAGQ02094 409 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 OR1C1Q15619 314 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 NSDHLQ15738 373 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 KRTCAP3Q53RY4 240 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 SFT2D3Q587I9 215 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 AGTRAPQ6RW13 159 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 GDF7Q7Z4P5 450 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 SCMH1Q96GD3 660 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 SIGLEC10Q96LC7 697 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 GPR137Q96N19 417 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 HES7Q9BYE0 225 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 ATG10Q9H0Y0 220 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 PARVBQ9HBI1 364 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 KLHL1Q9NR64 748 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 LANCL2Q9NS86 450 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 ANKRD10Q9NXR5 420 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF835Q9Y2P0 537 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 ASPDHA6ND91 283 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 MAN1A2O60476 641 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 C8GP07360 202 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 AGAP20933 346 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 IL10P22301 178 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 NAE1Q13564 534 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 ABRAXAS2Q15018 415 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 SPINK14Q6IE38 97 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
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PTPRF-216ENST00000617451 SGPP1Q9BX95 441 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 TINAGQ9UJW2 476 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 NEU2Q9Y3R4 380 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 FAM227AF5H4B4 570 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 MLYCDO95822 493 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 SLC35G6P0C7Q6 338 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 CDH1P12830 882 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 COX6B1P14854 86 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 CD46P15529 392 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 CCND1P24385 295 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 GRK3P35626 688 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 ST13P50502 369 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
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