RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606352.1

RNU6-90P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 90, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-90P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-90P-201ENST00000606352 NDST1P52848 882 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 RARSP54136 660 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 CDK3Q00526 305 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 PRKCEQ02156 737 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 KLC1Q07866 573 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 PRR4Q16378 134 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 DUSP5Q16690 384 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 C17orf58Q2M2W7 97 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 WSCD2Q2TBF2 565 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 TEX35Q5T0J7 233 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 JADE1Q6IE81 842 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 C11orf63Q6NUN7 778 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 ZNF836Q6ZNA1 936 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 CLEC17AQ6ZS10 378 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 IL17RELQ6ZVW7 336 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 TMPRSS11BQ86T26 416 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 MMD2Q8IY49 270 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 LGI2Q8N0V4 545 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 SSMEM1Q8WWF3 244 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 JAKMIP2Q96AA8 810 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 RNF125Q96EQ8 232 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 PERPQ96FX8 193 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 FNDC11Q9BVV2 318 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 HACD3Q9P035 362 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 CA5BQ9Y2D0 317 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 CMAHPQ9Y471 501 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 CPQQ9Y646 472 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 A0A087WZ39 114 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 TMEM150BA6NC51 233 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 ANKUB1A6NFN9 424 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 ZNF487B1APH4 448 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 INPP4BO15327 924 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 AIREO43918 545 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 CYTIPO60759 359 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 SAP30O75446 220 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 KRT18P05783 430 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 OR2T7P0C7T2 308 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 RARGP13631 454 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 PGAM2P15259 253 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 CD1DP15813 335 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 C4BPBP20851 252 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 FUT3P21217 361 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 CD34P28906 385 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 OAS2P29728 719 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 GABRA5P31644 462 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 SLC9A3P48764 834 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 VAMP7P51809 220 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 ZNF136P52737 540 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 CRYBA2P53672 197 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 EIF5P55010 431 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 ABRAXAS2Q15018 415 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 PHKG1Q16816 387 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 NHSL2Q5HYW2 709 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 MUC21Q5SSG8 566 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 KRT79Q5XKE5 535 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 FAAH2Q6GMR7 532 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 SLC24A5Q71RS6 500 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 MCM10Q7L590 875 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 MCEMP1Q8IX19 187 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 SCYL3Q8IZE3 742 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 TCEANCQ8N8B7 351 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 BANPQ8N9N5 519 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 OR5M9Q8NGP3 310 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 MARCH1Q8TCQ1 289 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 POMGNT1Q8WZA1 660 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 HVCN1Q96D96 273 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 ELMOD3Q96FG2 381 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 NEK1Q96PY6 1258 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 HSD17B14Q9BPX1 270 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 ZMYND12Q9H0C1 365 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 VCXQ9H320 206 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 TAS2R14Q9NYV8 317 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 KLRF1Q9NZS2 232 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-90P-201ENST00000606352 PHF11Q9UIL8 331 aa0.06□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.3 ms