RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 GPR21Q99679 349 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 RBCK1Q9BYM8 510 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 MMP25Q9NPA2 562 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 NPIPA1Q9UND3 350 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 MEMO1Q9Y316 297 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 FEZF1A0PJY2 475 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 RDH16O75452 317 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 FGGP02679 453 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 HRH2P25021 359 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 COILP38432 576 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 VPS41P49754 854 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 KRTCAP3Q53RY4 240 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKRD22Q5VYY1 191 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 PCGF5Q86SE9 256 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 CPNE9Q8IYJ1 553 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 TM4SF19Q96DZ7 209 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKHQ9HCJ1 492 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 DHRS7Q9Y394 339 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-211ENST00000590874 GABRR3A8MPY1 467 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNHIT1O43257 154 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 KIR3DL1P43629 444 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 RHAGQ02094 409 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 SFT2D3Q587I9 215 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 SIAH3Q8IW03 269 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 THAP11Q96EK4 314 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC68Q9H2F9 335 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 AKAP9Q99996 3911 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 NEURL1O76050 574 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 CLDN14O95500 239 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 CD46P15529 392 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC1A2P43004 574 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 MAGEA6P43360 314 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 ABRAXAS2Q15018 415 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 ARMC3Q5W041 872 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 ASPGQ86U10 573 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 CAMKVQ8NCB2 501 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 TSLPQ969D9 159 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 PEX11GQ96HA9 241 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 LANCL2Q9NS86 450 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 SAMD15Q9P1V8 674 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF860A6NHJ4 632 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 MLYCDO95822 493 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 KRTAP10-9P60411 292 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 SARNPP82979 210 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 HSF1Q00613 529 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 USP10Q14694 798 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 NSDHLQ15738 373 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC26A11Q86WA9 606 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC5A8Q8N695 610 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM178AQ8NBL3 297 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 SPC24Q8NBT2 197 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 OR5T3Q8NGG3 340 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 LPAR4Q99677 370 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM51Q9BSJ1 452 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 SP1P08047 785 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 GPS1Q13098 491 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 PLPP5Q8NEB5 264 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 MAIP1Q8WWC4 291 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC13A3Q8WWT9 602 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 ASNA1O43681 348 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 SSTR2P30874 369 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC26A5P58743 744 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 MPP1Q00013 466 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 AGAP11Q8TF27 550 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 OR1F2PQ96R84 312 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 PCBD2Q9H0N5 130 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 ATG10Q9H0Y0 220 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 CDCP1Q9H5V8 836 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 LRFN1Q9P244 771 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 PDE10AQ9Y233 779 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC22A7Q9Y694 548 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 PKDREJQ9NTG1 2253 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-211ENST00000590874 F8P00451 2351 aa24.1■■□□□ 1.45
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