RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589318.5

DDX39A-209, Transcript of DExD-box helicase 39A, human

TSL 1 (best)

Gene DDX39A, Length 1,903 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX39A-209	ENST00000589318	SLCO4C1	Q6ZQN7	724 aa		14.83	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	DEFB123	Q8N688	67 aa		14.83	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	FAM47B	Q8NA70	645 aa		14.83	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	TMEM145	Q8NBT3	493 aa		14.83	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		14.83	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	PDXP	Q96GD0	296 aa		14.83	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	ZNF347	Q96SE7	839 aa		14.83	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	14.83	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	14.83	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	ELOVL6	Q9H5J4	265 aa		14.83	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		14.83	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	ZIM2	Q9NZV7	527 aa		14.83	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	KLHL3	Q9UH77	587 aa		14.83	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		14.83	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	IFT52	Q9Y366	437 aa		14.83	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	POLR3H	Q9Y535	204 aa	Predicted RBP	14.83	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318		A0A1B0GTW7	788 aa		14.82	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318		H0YIV9	168 aa		14.82	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	14.82	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	NR5A2	O00482	541 aa		14.82	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	SCAMP1	O15126	338 aa		14.82	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	AKAP10	O43572	662 aa		14.82	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	BCL10	O95999	233 aa		14.82	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	SLC2A4	P14672	509 aa		14.82	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	PRPH2	P23942	346 aa		14.82	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	GNPDA1	P46926	289 aa		14.82	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	STARD6	P59095	220 aa		14.82	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	PRKG2	Q13237	762 aa		14.82	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	RPS6KA2	Q15349	733 aa		14.82	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	14.82	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	VPS26B	Q4G0F5	336 aa		14.82	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	GPR153	Q6NV75	609 aa		14.82	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	CYP20A1	Q6UW02	462 aa		14.82	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		14.82	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	ZFAND4	Q86XD8	727 aa		14.82	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	PGBD3	Q8N328	593 aa		14.82	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	RNF175	Q8N4F7	328 aa		14.82	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	NRBF2	Q96F24	287 aa		14.82	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	OSGEPL1	Q9H4B0	414 aa		14.82	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	LRTM1	Q9HBL6	345 aa		14.82	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		14.82	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	ASIC5	Q9NY37	505 aa		14.82	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	MAP10	Q9P2G4	905 aa		14.82	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	MOSPD1	Q9UJG1	213 aa		14.82	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		14.82	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	GPSM3	Q9Y4H4	160 aa		14.82	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	PCDHGA7	Q9Y5G6	932 aa		14.82	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	KCNE2	Q9Y6J6	123 aa		14.82	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		14.82	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	ASPDH	A6ND91	283 aa		14.82	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	MRAS	O14807	208 aa		14.82	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	KCNJ13	O60928	360 aa		14.82	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	SLC22A3	O75751	556 aa		14.82	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	RSL1D1	O76021	490 aa	Known RBP	14.82	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	CLPX	O76031	633 aa		14.82	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	HNF4A	P41235	474 aa		14.82	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	ZP2	Q05996	745 aa		14.82	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	NFATC3	Q12968	1075 aa		14.82	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	LRRC32	Q14392	662 aa		14.82	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	CLCA4	Q14CN2	919 aa		14.82	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	IMPG1	Q17R60	797 aa		14.82	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	MFSD4B	Q5TF39	518 aa		14.82	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	TBC1D21	Q8IYX1	336 aa		14.82	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	TSPEAR	Q8WU66	669 aa		14.82	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	RAB2B	Q8WUD1	216 aa		14.82	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	WDR34	Q96EX3	536 aa		14.82	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	TOE1	Q96GM8	510 aa	Known RBP	14.82	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	HHIP	Q96QV1	700 aa		14.82	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	FOXQ1	Q9C009	403 aa		14.82	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	ARMC7	Q9H6L4	198 aa		14.82	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	GPN2	Q9H9Y4	310 aa	Predicted RBP	14.82	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	CARS2	Q9HA77	564 aa	Known RBP	14.82	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	CCDC177	Q9NQR7	707 aa	Predicted RBP	14.82	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		14.82	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	C1orf109	Q9NX04	203 aa		14.82	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	WSB2	Q9NYS7	404 aa	Predicted RBP	14.82	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	WNT16	Q9UBV4	365 aa		14.82	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318		A0A1W2PPW3	197 aa		14.81	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	BBIP1	A8MTZ0	92 aa		14.81	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	RPN2	P04844	631 aa		14.81	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	14.81	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	ZNF33B	Q06732	778 aa		14.81	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	CAMK2B	Q13554	666 aa		14.81	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	RAB39A	Q14964	217 aa		14.81	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	ARHGAP19	Q14CB8	494 aa		14.81	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		14.81	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	CATSPERE	Q5SY80	951 aa		14.81	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	ADNP2	Q6IQ32	1131 aa		14.81	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	ENPP7	Q6UWV6	458 aa		14.81	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		14.81	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	TMPRSS11B	Q86T26	416 aa		14.81	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		14.81	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	FRMD1	Q8N878	549 aa		14.81	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	ARL10	Q8N8L6	244 aa		14.81	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	GOLM1	Q8NBJ4	401 aa		14.81	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	S100Z	Q8WXG8	99 aa		14.81	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	C12orf66	Q96MD2	445 aa		14.81	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	WDR92	Q96MX6	357 aa		14.81	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	OR2M4	Q96R27	311 aa		14.81	□□□□□ -0.04
DDX39A-209	ENST00000589318	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	14.81	□□□□□ -0.04

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