RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa14.55□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa14.55□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 CNIH3Q8TBE1 160 aa14.55□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 TSPEARQ8WU66 669 aa14.55□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 SH3KBP1Q96B97 665 aa14.55□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 TPD52L3Q96J77 140 aa14.55□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 DHRS9Q9BPW9 319 aa14.55□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 PLAGL1Q9UM63 463 aa14.55□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 HS3ST2Q9Y278 367 aa14.55□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 MAGEB17A8MXT2 336 aa14.55□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 ARNTLO00327 626 aa14.55□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 SNPHO15079 494 aa14.55□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 GRM6O15303 877 aa14.55□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 XYLBO75191 536 aa14.55□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 OPN1SWP03999 348 aa14.55□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 ALPLP05186 524 aa14.55□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 CTSAP10619 480 aa14.55□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 THRBP10828 461 aa14.55□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 MATN1P21941 496 aa14.55□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 SLC13A2Q13183 592 aa14.55□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 KCNAB2Q13303 367 aa14.55□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 STARD3Q14849 445 aa14.55□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 LRIT3Q3SXY7 679 aa14.55□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 NOXRED1Q6NXP6 359 aa14.55□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 USP7Q93009 1102 aa14.55□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 HAT1O14929 419 aa14.54□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 MOSPD3O75425 235 aa14.54□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 FTH1P02794 183 aa14.54□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 ACPPP15309 386 aa14.54□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 DAG1Q14118 895 aa14.54□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 DOC2AQ14183 400 aa14.54□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 SYTL3Q4VX76 610 aa14.54□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 CATSPEREQ5SY80 951 aa14.54□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 FRG2Q64ET8 278 aa14.54□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 CRTC3Q6UUV7 619 aa14.54□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 CEP68Q76N32 757 aa14.54□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 MICU2Q8IYU8 434 aa14.54□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 OR4K1Q8NGD4 311 aa14.54□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 MCOLN3Q8TDD5 553 aa14.54□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 ECHDC3Q96DC8 303 aa14.54□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 LMLNQ96KR4 655 aa14.54□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 FRG2BQ96QU4 278 aa14.54□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 OR4K3Q96R72 315 aa14.54□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 NINQ8N4C6 2090 aa14.54□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 POM121CA8CG34 1229 aa14.54□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 H0YJX3 145 aa14.54□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 RGS13O14921 159 aa14.54□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 ASNA1O43681 348 aa14.54□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 CLPXO76031 633 aa14.54□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 FKBP9O95302 570 aa14.54□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 FCGR1AP12314 374 aa14.54□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 SERPINB1P30740 379 aa14.54□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 LSM3P62310 102 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 LILRA6Q6PI73 481 aa14.54□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 FKBP9P1Q75LS8 142 aa14.54□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 NECAB2Q7Z6G3 386 aa14.54□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 FAM217AQ8IXS0 508 aa14.54□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 NELL2Q99435 816 aa14.54□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 SLC12A9Q9BXP2 914 aa14.54□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 SPHK2Q9NRA0 654 aa14.54□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 SH3BP4Q9P0V3 963 aa14.54□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 RWDD3Q9Y3V2 267 aa14.54□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 GRXCR2A6NFK2 248 aa14.53□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 COX7A2P14406 83 aa14.53□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 TIMP2P16035 220 aa14.53□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 ENGP17813 658 aa14.53□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 ALDH4A1P30038 563 aa14.53□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 S100A5P33763 92 aa14.53□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 PTGS2P35354 604 aa14.53□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 MC1RQ01726 317 aa14.53□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 TMEM220Q6QAJ8 160 aa14.53□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 GLRX5Q86SX6 157 aa14.53□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 MMP21Q8N119 569 aa14.53□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 ZNF740Q8NDX6 193 aa14.53□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 IL17FQ96PD4 163 aa14.53□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 DNAJC11Q9NVH1 559 aa14.53□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 TRPS1Q9UHF7 1281 aa14.53□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa14.53□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 CLDN25C9JDP6 229 aa14.53□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 NUAK1O60285 661 aa14.53□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 IL6P05231 212 aa14.53□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 NUMA1Q14980 2115 aa14.53□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 CFAP206Q8IYR0 622 aa14.53□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 SDCCAG3Q96C92 435 aa14.53□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CTIF-205ENST00000587860 RUBCNLQ9H714 662 aa14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms