RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 CPNE1Q99829 537 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 MACROD1Q9BQ69 325 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 LRRC1Q9BTT6 524 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 SGPP1Q9BX95 441 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 CAB39LQ9H9S4 337 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 ANKHQ9HCJ1 492 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 PRM3Q9NNZ6 103 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 MLXIPLQ9NP71 852 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 SMYD2Q9NRG4 433 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 ENAMQ9NRM1 1142 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 GRHL1Q9NZI5 618 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 LUZP4Q9P127 313 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 C5AR2Q9P296 337 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 SH2B3Q9UQQ2 575 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 SLC22A14Q9Y267 594 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 KCNE2Q9Y6J6 123 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 COL12A1Q99715 3063 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 IDSB3KWA1 339 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 SOCS6O14544 535 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 VPS4BO75351 444 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 SLC35G6P0C7Q6 338 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC166P0CW27 439 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 ACPPP15309 386 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 STMN1P16949 149 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 IL1RNP18510 177 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 STX2P32856 288 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 SPRP35270 261 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 GP5P40197 560 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 SLC26A3P40879 764 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 BCL6P41182 706 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 MAGEA4P43358 317 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 HNMTP50135 292 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
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PTPRM-214ENST00000583153 TRADDQ15628 312 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 TSNQ15631 228 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 SYT16Q17RD7 645 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 MINDY4Q4G0A6 757 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 CATSPEREQ5SY80 951 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 GRTP1Q5TC63 336 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 RAPH1Q70E73 1250 aa7.9□□□□□ -1.14
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PTPRM-214ENST00000583153 CEP97Q8IW35 865 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 MFSD9Q8NBP5 474 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 KCT2Q8NC54 265 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 OR11G2Q8NGC1 345 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 OR9A4Q8NGU2 314 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 OR51Q1Q8NH59 317 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 CPT1CQ8TCG5 803 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 ANKRD49Q8WVL7 239 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 SLC5A11Q8WWX8 675 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 METTL21AQ8WXB1 218 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 C8orf44Q96CB5 159 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 TSNARE1Q96NA8 513 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 RBBP8Q99708 897 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 FAM129AQ9BZQ8 928 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 SYNPO2LQ9H987 977 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF160Q9HCG1 818 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 C14orf105Q9NVL8 296 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 IKZF3Q9UKT9 509 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 MKL2Q9ULH7 1088 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 VPS4AQ9UN37 437 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 PLAAQ9Y263 795 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 OARD1Q9Y530 152 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 ESYT3A0FGR9 886 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 FAM159BA6NKW6 160 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 H0YIG0 161 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 SGK494L7N484 410 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 NDUFS4O43181 175 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 FOXS1O43638 330 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 WDR47O94967 919 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 NSA2O95478 260 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
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