RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 CPA3P15088 417 aa31.56■■■□□ 2.64
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CTDNEP1-209ENST00000574205 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP31.56■■■□□ 2.64
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP31.56■■■□□ 2.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa31.56■■■□□ 2.64
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP31.54■■■□□ 2.64
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CTDNEP1-209ENST00000574205 C1orf189Q5VU69 101 aa31.54■■■□□ 2.64
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP31.54■■■□□ 2.64
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SERPINA6P08185 405 aa31.5■■■□□ 2.63
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRAF3Q13114 568 aa31.5■■■□□ 2.63
CTDNEP1-209ENST00000574205 RBBP7Q16576 425 aa31.5■■■□□ 2.63
CTDNEP1-209ENST00000574205 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa31.5■■■□□ 2.63
CTDNEP1-209ENST00000574205 LIPMQ5VYY2 423 aa31.5■■■□□ 2.63
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