RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568290.1

ATXN3-250, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 671 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-250ENST00000568290 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa7.38□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 FAR1Q8WVX9 515 aa7.38□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 ELMO1Q92556 727 aa7.38□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 TAMM41Q96BW9 452 aa7.38□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 LGALS12Q96DT0 336 aa7.38□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 YIPF6Q96EC8 236 aa7.38□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 ALG14Q96F25 216 aa7.38□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 HSH2DQ96JZ2 352 aa7.38□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 CEP19Q96LK0 163 aa7.38□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 HHIPQ96QV1 700 aa7.38□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 HEPHQ9BQS7 1158 aa7.38□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 COPS4Q9BT78 406 aa7.38□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa7.38□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 CFHR5Q9BXR6 569 aa7.38□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa7.38□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 PCBD2Q9H0N5 130 aa7.38□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 TMEM38AQ9H6F2 299 aa7.38□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 REEP4Q9H6H4 257 aa7.38□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 SGK2Q9HBY8 427 aa7.38□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 ACOT13Q9NPJ3 140 aa7.38□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 SERHLQ9NQF3 203 aa7.38□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 THSD1Q9NS62 852 aa7.38□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 GKN1Q9NS71 199 aa7.38□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 CLN6Q9NWW5 311 aa7.38□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 ELOVL2Q9NXB9 296 aa7.38□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa7.38□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 LMCD1Q9NZU5 365 aa7.38□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 SELENONQ9NZV5 590 aa7.38□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 DKK3Q9UBP4 350 aa7.38□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 KLHL3Q9UH77 587 aa7.38□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 ATP6V1HQ9UI12 483 aa7.38□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 GABRQQ9UN88 632 aa7.38□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 INSL5Q9Y5Q6 135 aa7.38□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 MYLKQ15746 1914 aa7.38□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 CHD5Q8TDI0 1954 aa7.37□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 GBF1Q92538 1859 aa7.37□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 FRMPD3Q5JV73 1810 aa7.37□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa7.37□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 A0A1B0GTL3 188 aa7.37□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa7.37□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 CLCA1A8K7I4 914 aa7.37□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 PDZK1P1A8MUH7 402 aa7.37□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 FADS2P1A8MWK0 482 aa7.37□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 C5orf58C9J3I9 102 aa7.37□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 GFRA2O00451 464 aa7.37□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 PI15O43692 258 aa7.37□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 AIREO43918 545 aa7.37□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 SH3BP5O60239 455 aa7.37□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 KCNK5O95279 499 aa7.37□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 CXCL10P02778 98 aa7.37□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 MT-ND1P03886 318 aa7.37□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 ARSAP15289 507 aa7.37□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 CD36P16671 472 aa7.37□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 IL7RP16871 459 aa7.37□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP7.37□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 CCR7P32248 378 aa7.37□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 ST8SIA6P61647 398 aa7.37□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 RPP38P78345 283 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 PRKCDQ05655 676 aa7.37□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 RUNX1T1Q06455 604 aa7.37□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 ZNF763Q0D2J5 394 aa7.37□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 RAPSNQ13702 412 aa7.37□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 ATP1A4Q13733 1029 aa7.37□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 RGNQ15493 299 aa7.37□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 CTF1Q16619 201 aa7.37□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 CDKN3Q16667 212 aa7.37□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 CYP2A13Q16696 494 aa7.37□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 HKDC1Q2TB90 917 aa7.37□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 FBXO48Q5FWF7 155 aa7.37□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa7.37□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 OR4F3Q6IEY1 312 aa7.37□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 CNKSR3Q6P9H4 555 aa7.37□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 BHLHB9Q6PI77 547 aa7.37□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 CCDC81Q6ZN84 652 aa7.37□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa7.37□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 Q6ZVU0 165 aa7.37□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 CCDC80Q76M96 950 aa7.37□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 IGFN1Q86VF2 1251 aa7.37□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 MSRB3Q8IXL7 192 aa7.37□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 TAGAPQ8N103 731 aa7.37□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 TBC1D19Q8N5T2 526 aa7.37□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 CLDN19Q8N6F1 224 aa7.37□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa7.37□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa7.37□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 OR4A15Q8NGL6 344 aa7.37□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 RHOXF1Q8NHV9 184 aa7.37□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 SETD6Q8TBK2 473 aa7.37□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 SPPL2AQ8TCT8 520 aa7.37□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 SH3RF2Q8TEC5 729 aa7.37□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 FKBP10Q96AY3 582 aa7.37□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 COQ8BQ96D53 544 aa7.37□□□□□ -1.23
ATXN3-250ENST00000568290 ZNF607Q96SK3 696 aa7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.5 ms