RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562866.1

VPS9D1-AS1-202, VPS9D1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS9D1-AS1, Length 1,753 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TRIM64CA6NLI5 447 aa20.52■□□□□ 0.88
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ERGP11308 486 aa20.52■□□□□ 0.88
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CXCR2P25025 360 aa20.52■□□□□ 0.88
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MAGEA2P43356 314 aa20.52■□□□□ 0.88
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TNFRSF4P43489 277 aa20.52■□□□□ 0.88
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP20.52■□□□□ 0.88
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ATAT1Q5SQI0 421 aa20.52■□□□□ 0.88
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TTC23Q5W5X9 447 aa20.52■□□□□ 0.88
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa20.52■□□□□ 0.88
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LPCAT2Q7L5N7 544 aa20.52■□□□□ 0.88
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 OR5K2Q8NHB8 316 aa20.52■□□□□ 0.88
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TBC1D20Q96BZ9 403 aa20.52■□□□□ 0.88
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ERLEC1Q96DZ1 483 aa20.52■□□□□ 0.88
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MTERF3Q96E29 417 aa20.52■□□□□ 0.88
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MYADMQ96S97 322 aa20.52■□□□□ 0.88
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PBX4Q9BYU1 374 aa20.52■□□□□ 0.88
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 WDR26Q9H7D7 661 aa20.52■□□□□ 0.88
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PELI2Q9HAT8 420 aa20.52■□□□□ 0.88
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MYNNQ9NPC7 610 aa20.52■□□□□ 0.88
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 AHSPQ9NZD4 102 aa20.52■□□□□ 0.88
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SH3BP4Q9P0V3 963 aa20.52■□□□□ 0.88
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SPATA7Q9P0W8 599 aa20.52■□□□□ 0.88
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ACSL5Q9ULC5 683 aa20.52■□□□□ 0.88
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 BTBD3Q9Y2F9 522 aa20.52■□□□□ 0.88
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CCDC160A6NGH7 325 aa20.51■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 VILLO15195 856 aa20.51■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 YY2O15391 372 aa20.51■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 E2F6O75461 281 aa20.51■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 WASP42768 502 aa20.51■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ARMCX6Q7L4S7 300 aa20.51■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 OR4A15Q8NGL6 344 aa20.51■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SLC23A2Q9UGH3 650 aa20.51■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF682O95780 498 aa20.51■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TGFB1P01137 390 aa20.51■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SLC35G4P0C7Q5 338 aa20.51■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SERPINB1P30740 379 aa20.51■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KDELR2P33947 212 aa20.51■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa20.51■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 IKBIPQ70UQ0 350 aa20.51■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 C17orf64Q86WR6 236 aa20.51■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa20.51■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa20.51■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SYNPOQ8N3V7 929 aa20.51■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RAB42Q8N4Z0 105 aa20.51■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF555Q8NEP9 628 aa20.51■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PJA1Q8NG27 643 aa20.51■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP20.51■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 C16orf78Q8WTQ4 265 aa20.51■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 IL17FQ96PD4 163 aa20.51■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa20.51■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 OR51B5Q9H339 312 aa20.51■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PTTG2Q9NZH5 202 aa20.51■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 C1orf226A1L170 272 aa20.5■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ESRRGP62508 458 aa20.5■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PPP2R2BQ00005 443 aa20.5■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PDE7AQ13946 482 aa20.5■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RAB30Q15771 203 aa20.5■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RFX4Q33E94 735 aa20.5■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SPESP1Q6UW49 350 aa20.5■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PTOV1Q86YD1 416 aa20.5■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 OFCC1Q8IZS5 231 aa20.5■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZFP90Q8TF47 636 aa20.5■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PPCDCQ96CD2 204 aa20.5■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LGR4Q9BXB1 951 aa20.5■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FZD4Q9ULV1 537 aa20.5■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PLAGL1Q9UM63 463 aa20.5■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ORC6Q9Y5N6 252 aa20.5■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ANTXRLA6NF34 631 aa20.49■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DCTP40126 519 aa20.49■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DMPKQ09013 629 aa20.49■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa20.49■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FAM129CQ86XR2 697 aa20.49■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa20.49■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 WDR48Q8TAF3 677 aa20.49■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa20.49■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SMPDL3AQ92484 453 aa20.49■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 AIF1LQ9BQI0 150 aa20.49■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TM9SF3Q9HD45 589 aa20.49■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 IL1RAPQ9NPH3 570 aa20.49■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 UTS2RQ9UKP6 389 aa20.49■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 BAG5Q9UL15 447 aa20.49■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 A0A1W2PP55 124 aa20.49■□□□□ 0.87
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SEMA3DO95025 777 aa20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms