RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562291.2

INO80E-204, Transcript of INO80 complex subunit E, humanhuman

TSL 3

Gene INO80E, Length 255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80E-204ENST00000562291 CATSPER1Q8NEC5 780 aa9.16□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 SPATA4Q8NEY3 305 aa9.16□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 ABHD11Q8NFV4 315 aa9.16□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 OR4K1Q8NGD4 311 aa9.16□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 OR1N1Q8NGS0 311 aa9.16□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa9.16□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 PPP4R1Q8TF05 950 aa9.16□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 ANKRD7Q92527 254 aa9.16□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 EGFL8Q99944 293 aa9.16□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 ZNF700Q9H0M5 742 aa9.16□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 SAYSD1Q9NPB0 183 aa9.16□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa9.16□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 PLA2G3Q9NZ20 509 aa9.16□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 WHRNQ9P202 907 aa9.16□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 PTGFRNQ9P2B2 879 aa9.16□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa9.16□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 DYRK1BQ9Y463 629 aa9.16□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 SLC22A7Q9Y694 548 aa9.16□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 SHANK1Q9Y566 2161 aa9.16□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa9.15□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 TRBC2A0A5B9 178 aa9.15□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 DYTNA2CJ06 578 aa9.15□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 OR2W5A6NFC9 320 aa9.15□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP9.15□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 RAD51CO43502 376 aa9.15□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 CBX6O95503 412 aa9.15□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 SLC35G6P0C7Q6 338 aa9.15□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 C8orf89P0DMQ9 161 aa9.15□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 SSTR1P30872 391 aa9.15□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 XCR1P46094 333 aa9.15□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 AP2B1P63010 937 aa9.15□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 ARG2P78540 354 aa9.15□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 CDC16Q13042 620 aa9.15□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 CBLBQ13191 982 aa9.15□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 MFAP5Q13361 173 aa9.15□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 PWP1Q13610 501 aa9.15□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 HERC3Q15034 1050 aa9.15□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 TLR1Q15399 786 aa9.15□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 NR6A1Q15406 480 aa9.15□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 MINDY4Q4G0A6 757 aa9.15□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 CATSPEREQ5SY80 951 aa9.15□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 SIRT6Q8N6T7 355 aa9.15□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 SLC5A11Q8WWX8 675 aa9.15□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 CDKL2Q92772 493 aa9.15□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 HAS2Q92819 552 aa9.15□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 NEIL2Q969S2 332 aa9.15□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 OR4K3Q96R72 315 aa9.15□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 TUBB6Q9BUF5 446 aa9.15□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 SARGQ9BW04 601 aa9.15□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 VN1R1Q9GZP7 353 aa9.15□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 RHOJQ9H4E5 214 aa9.15□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 GPAMQ9HCL2 828 aa9.15□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 RIC8BQ9NVN3 520 aa9.15□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 STMN3Q9NZ72 180 aa9.15□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 HCN3Q9P1Z3 774 aa9.15□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 TXNDC16Q9P2K2 825 aa9.15□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 IKZF3Q9UKT9 509 aa9.15□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 SLC22A14Q9Y267 594 aa9.15□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa9.15□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa9.15□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 CSAG2Q9Y5P2 127 aa9.15□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 KCNE2Q9Y6J6 123 aa9.15□□□□□ -0.94
INO80E-204ENST00000562291 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
INO80E-204ENST00000562291 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa9.14□□□□□ -0.95
INO80E-204ENST00000562291 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa9.14□□□□□ -0.95
INO80E-204ENST00000562291 ANKUB1A6NFN9 424 aa9.14□□□□□ -0.95
INO80E-204ENST00000562291 URADA6NGE7 173 aa9.14□□□□□ -0.95
INO80E-204ENST00000562291 A8MUI8 341 aa9.14□□□□□ -0.95
INO80E-204ENST00000562291 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
INO80E-204ENST00000562291 DYNC1I1O14576 645 aa9.14□□□□□ -0.95
INO80E-204ENST00000562291 FANCGO15287 622 aa9.14□□□□□ -0.95
INO80E-204ENST00000562291 NDUFS4O43181 175 aa9.14□□□□□ -0.95
INO80E-204ENST00000562291 SEMA7AO75326 666 aa9.14□□□□□ -0.95
INO80E-204ENST00000562291 RDH16O75452 317 aa9.14□□□□□ -0.95
INO80E-204ENST00000562291 PIAS1O75925 651 aa9.14□□□□□ -0.95
INO80E-204ENST00000562291 MYBL2P10244 700 aa9.14□□□□□ -0.95
INO80E-204ENST00000562291 ITGAMP11215 1152 aa9.14□□□□□ -0.95
INO80E-204ENST00000562291 GP1BBP13224 206 aa9.14□□□□□ -0.95
INO80E-204ENST00000562291 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
INO80E-204ENST00000562291 IL10P22301 178 aa9.14□□□□□ -0.95
INO80E-204ENST00000562291 TSFMP43897 325 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
INO80E-204ENST00000562291 PLTPP55058 493 aa9.14□□□□□ -0.95
INO80E-204ENST00000562291 ETF1P62495 437 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
INO80E-204ENST00000562291 CDKL1Q00532 357 aa9.14□□□□□ -0.95
INO80E-204ENST00000562291 POU4F1Q01851 419 aa9.14□□□□□ -0.95
INO80E-204ENST00000562291 RGS1Q08116 209 aa9.14□□□□□ -0.95
INO80E-204ENST00000562291 C2orf54Q08AI8 447 aa9.14□□□□□ -0.95
INO80E-204ENST00000562291 ZNF460Q14592 562 aa9.14□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.8 ms