RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551931.5

LETMD1-231, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 3

Gene LETMD1, Length 705 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-231	ENST00000551931	MPC1L	P0DKB6	136 aa		11.85	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	AGA	P20933	346 aa		11.85	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	EEF1D	P29692	281 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	BCL6	P41182	706 aa		11.85	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	KIR3DL1	P43629	444 aa		11.85	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	SMS	P52788	366 aa		11.85	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	RPS15A	P62244	130 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	TBPL1	P62380	186 aa		11.85	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	CSNK1G2	P78368	415 aa		11.85	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	CDK16	Q00536	496 aa		11.85	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	ALDH6A1	Q02252	535 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	CTBP1	Q13363	440 aa		11.85	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	PTK6	Q13882	451 aa		11.85	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	MEP1A	Q16819	746 aa		11.85	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		11.85	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	C4orf22	Q6V702	233 aa		11.85	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	PIWIL4	Q7Z3Z4	852 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		11.85	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	SIAH3	Q8IW03	269 aa		11.85	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	CPNE9	Q8IYJ1	553 aa		11.85	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	KCT2	Q8NC54	265 aa		11.85	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	CD200R1	Q8TD46	325 aa		11.85	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	TM4SF19	Q96DZ7	209 aa		11.85	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	UTP23	Q9BRU9	249 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	TMEM184C	Q9NVA4	438 aa		11.85	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	GUCA1B	Q9UMX6	200 aa		11.85	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	NPIPA1	Q9UND3	350 aa		11.85	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	MEMO1	Q9Y316	297 aa		11.85	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	KCNE1B	A0A087WTH5	132 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	FEZF1	A0PJY2	475 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF860	A6NHJ4	632 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	GABRR3	A8MPY1	467 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	ZBTB14	O43829	449 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	KIF5C	O60282	957 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	CDC123	O75794	336 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	NEURL1	O76050	574 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	CLDN14	O95500	239 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	PAM	P19021	973 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	VPS41	P49754	854 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	AGTR2	P50052	363 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	HSF1	Q00613	529 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	RHAG	Q02094	409 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	RPS6KA1	Q15418	735 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	EXT1	Q16394	746 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	SFT2D3	Q587I9	215 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	CASC4	Q6P4E1	433 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	PAPD4	Q6PIY7	484 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	MBOAT1	Q6ZNC8	495 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	UBE2R2	Q712K3	238 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	GALNTL5	Q7Z4T8	443 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	PCGF5	Q86SE9	256 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	M1AP	Q8TC57	530 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	KCNJ9	Q92806	393 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	TSLP	Q969D9	159 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	GPR21	Q99679	349 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	MMP25	Q9NPA2	562 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	CCDC177	Q9NQR7	707 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	LANCL2	Q9NS86	450 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	KLHL42	Q9P2K6	505 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	VPS9D1	Q9Y2B5	631 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	DHRS7	Q9Y394	339 aa		11.84	□□□□□ -0.51
LETMD1-231	ENST00000551931	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-231	ENST00000551931	CTAGE9	A4FU28	777 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-231	ENST00000551931	LCMT2	O60294	686 aa	Known RBP	11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-231	ENST00000551931	FGG	P02679	453 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-231	ENST00000551931	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-231	ENST00000551931	CD46	P15529	392 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC1A2	P43004	574 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-231	ENST00000551931	OC90	Q02509	493 aa	Predicted RBP	11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-231	ENST00000551931	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-231	ENST00000551931	ABRAXAS2	Q15018	415 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-231	ENST00000551931	NSDHL	Q15738	373 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-231	ENST00000551931	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-231	ENST00000551931	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-231	ENST00000551931	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-231	ENST00000551931	ASPG	Q86U10	573 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-231	ENST00000551931	KIF2B	Q8N4N8	673 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-231	ENST00000551931	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-231	ENST00000551931	CAMKV	Q8NCB2	501 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-231	ENST00000551931	OR5T3	Q8NGG3	340 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-231	ENST00000551931	MCOLN3	Q8TDD5	553 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-231	ENST00000551931	PEX11G	Q96HA9	241 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-231	ENST00000551931	LPAR4	Q99677	370 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-231	ENST00000551931	ANKH	Q9HCJ1	492 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-231	ENST00000551931	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-231	ENST00000551931	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		11.83	□□□□□ -0.52
LETMD1-231	ENST00000551931	NAALAD2	Q9Y3Q0	740 aa		11.83	□□□□□ -0.52

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