RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM52BQ4KMG9 183 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 C9orf50Q5SZB4 431 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 REP15Q6BDI9 236 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 OR14A16Q8NHC5 309 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 TSSK3Q96PN8 268 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 C1GALT1Q9NS00 363 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 ACTR10Q9NZ32 417 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 COPG2Q9UBF2 871 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 DHRS7Q9Y394 339 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 A0A0U1RQJ8 604 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 SERPINA1P01009 418 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 GSTT2P0CG29 244 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 GSTT2BP0CG30 244 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 IL32P24001 234 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 MYL9P24844 172 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 CRHR1P34998 444 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 RCVRNP35243 200 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 MNDAP41218 407 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 GSCP56915 257 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 HSPB3Q12988 150 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 MYBPC3Q14896 1274 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 ZBTB6Q15916 424 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 RAB11FIP2Q7L804 512 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 SLC22A15Q8IZD6 547 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 SLC44A3Q8N4M1 653 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 MYDGFQ969H8 173 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 SARAFQ96BY9 339 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 SAR1AQ9NR31 198 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 NDUFA13Q9P0J0 144 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 BCORQ6W2J9 1755 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 DRGXA6NNA5 263 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 SLC22A2O15244 555 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 UGT1A9O60656 530 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 C8BP07358 591 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 UGT1A6P19224 532 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 GDI2P50395 445 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 ST13P50502 369 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 VASPP50552 380 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 CYP27C1Q4G0S4 372 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 DEF8Q6ZN54 512 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 MISPQ8IVT2 679 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 CARFQ8N187 725 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 OR14L1PQ8NHC6 308 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 SPATA22Q8NHS9 363 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM40Q8WWA1 233 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 ART4Q93070 314 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 UGT1A7Q9HAW7 530 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 UGT1A10Q9HAW8 530 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 UGT1A8Q9HAW9 530 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 PRSS38A1L453 326 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 FIGNL2A6NMB9 653 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 CCRL2O00421 344 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 SDC3O75056 442 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 CKMT2P17540 419 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 MAGEA8P43361 318 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 CHN2P52757 468 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 HMBOX1Q6NT76 420 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 SLC39A4Q6P5W5 647 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 SYVN1Q86TM6 617 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 PROKR1Q8TCW9 393 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 DIO2Q92813 273 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 UTS2RQ9UKP6 389 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 HS3ST2Q9Y278 367 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 TIAM2Q8IVF5 1701 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 SCRG1O75711 98 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 ANPEPP15144 967 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 PNCKQ6P2M8 343 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 GLIS3Q8NEA6 775 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 HS6ST2Q96MM7 605 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 ABCG8Q9H221 673 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 CWH43Q9H720 699 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 MYH13Q9UKX3 1938 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 NAV1Q8NEY1 1877 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 MAGEB17A8MXT2 336 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 C2CD4DB7Z1M9 353 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 GFRA3O60609 400 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 ACRV1P26436 265 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 ETV3P41162 512 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 NME5P56597 212 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRB-209ENST00000550857 RPS23P62266 143 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms