RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548041.5

CS-211, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-211ENST00000548041 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 KCT2Q8NC54 265 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 SLC13A3Q8WWT9 602 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 TM4SF19Q96DZ7 209 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 AIF1LQ9BQI0 150 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 SARGQ9BW04 601 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 NLNQ9BYT8 704 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 AICDAQ9GZX7 198 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 ACSS2Q9NR19 701 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 GPRC5BQ9NZH0 403 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 OPTCQ9UBM4 332 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 CTSFQ9UBX1 484 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 KCND3Q9UK17 655 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 TCFL5Q9UL49 500 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 PLAAQ9Y263 795 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 CCDC189A1A4V9 331 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 ZNF860A6NHJ4 632 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 A8MT66 165 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 I3L1I5 382 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 E2F3O00716 465 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 CLGNO14967 610 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 CDH16O75309 829 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 CREG1O75629 220 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 RBP1P09455 135 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 RAB40ALP0C0E4 278 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 SLC35G6P0C7Q6 338 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 FBLP22087 321 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 RPS15P62841 145 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 IFFO1Q0D2I5 559 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 HYAL2Q12891 473 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 CHIT1Q13231 466 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP8.19□□□□□ -1.19e-14■■■□□ 15.6
CS-211ENST00000548041 XKR6Q5GH73 641 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 GARNL3Q5VVW2 1013 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 PCSK4Q6UW60 755 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 SH2D5Q6ZV89 423 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 VN1R5Q7Z5H4 357 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 PDSS2Q86YH6 399 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 C4orf33Q8N1A6 199 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 RNF175Q8N4F7 328 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 AMER3Q8N944 861 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 OR9A4Q8NGU2 314 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 ACMSDQ8TDX5 336 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 TTC9Q92623 222 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 EXTL1Q92935 676 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 THAP11Q96EK4 314 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 SPSB2Q99619 263 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 EFHD1Q9BUP0 239 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 DRC3Q9H069 523 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 ZNF304Q9HCX3 659 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 ZFP69BQ9UJL9 534 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 EMCNQ9ULC0 261 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 A0A0G2JN53 185 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 SGK494L7N484 410 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 TXNDC9O14530 226 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 OR7A17O14581 309 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 STX16O14662 325 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 SMIM24O75264 130 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 GLRA3O75311 464 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 RDH16O75452 317 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 UMODP07911 640 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 RPS17P08708 135 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 EPB42P16452 691 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 TSPAN8P19075 237 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 AHRP35869 848 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 HNF4AP41235 474 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 EFNA3P52797 238 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 EMP3P54852 163 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 IRF8Q02556 426 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 GTF2H2Q13888 395 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 E2F2Q14209 437 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 RASA2Q15283 850 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 NKG7Q16617 165 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 NDUFA9Q16795 377 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 DEFB109BQ30KR1 87 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 LINC00303Q3SY05 128 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 VWA2Q5GFL6 755 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-211ENST00000548041 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa8.18□□□□□ -1.1
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