RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541982.5

CD4-210, Transcript of CD4 molecule, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CD4, Length 1,187 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD4-210ENST00000541982 HCFC1P51610 2035 aa14.65□□□□□ -0.06
CD4-210ENST00000541982 ARHGEF33A8MVX0 844 aa14.65□□□□□ -0.06
CD4-210ENST00000541982 H0YIG0 161 aa14.65□□□□□ -0.06
CD4-210ENST00000541982 AVILO75366 819 aa14.65□□□□□ -0.06
CD4-210ENST00000541982 SP1P08047 785 aa14.65□□□□□ -0.06
CD4-210ENST00000541982 CXCR5P32302 372 aa14.65□□□□□ -0.06
CD4-210ENST00000541982 TAS2R50P59544 299 aa14.65□□□□□ -0.06
CD4-210ENST00000541982 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CD4-210ENST00000541982 GPS1Q13098 491 aa14.65□□□□□ -0.06
CD4-210ENST00000541982 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CD4-210ENST00000541982 MINDY4Q4G0A6 757 aa14.65□□□□□ -0.06
CD4-210ENST00000541982 TMEM211Q6ICI0 200 aa14.65□□□□□ -0.06
CD4-210ENST00000541982 SPINK14Q6IE38 97 aa14.65□□□□□ -0.06
CD4-210ENST00000541982 SLC25A25Q6KCM7 469 aa14.65□□□□□ -0.06
CD4-210ENST00000541982 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CD4-210ENST00000541982 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CD4-210ENST00000541982 PAQR7Q86WK9 346 aa14.65□□□□□ -0.06
CD4-210ENST00000541982 CRLF3Q8IUI8 442 aa14.65□□□□□ -0.06
CD4-210ENST00000541982 LRRC8AQ8IWT6 810 aa14.65□□□□□ -0.06
CD4-210ENST00000541982 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CD4-210ENST00000541982 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CD4-210ENST00000541982 MCUQ8NE86 351 aa14.65□□□□□ -0.06
CD4-210ENST00000541982 ASB5Q8WWX0 329 aa14.65□□□□□ -0.06
CD4-210ENST00000541982 FAM136AQ96C01 138 aa14.65□□□□□ -0.06
CD4-210ENST00000541982 OR2A5Q96R48 311 aa14.65□□□□□ -0.06
CD4-210ENST00000541982 HES7Q9BYE0 225 aa14.65□□□□□ -0.06
CD4-210ENST00000541982 SLC24A3Q9HC58 644 aa14.65□□□□□ -0.06
CD4-210ENST00000541982 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CD4-210ENST00000541982 MMP25Q9NPA2 562 aa14.65□□□□□ -0.06
CD4-210ENST00000541982 ANKRD10Q9NXR5 420 aa14.65□□□□□ -0.06
CD4-210ENST00000541982 SAMD15Q9P1V8 674 aa14.65□□□□□ -0.06
CD4-210ENST00000541982 GALPQ9UBC7 116 aa14.65□□□□□ -0.06
CD4-210ENST00000541982 ABCA2Q9BZC7 2435 aa14.64□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa14.64□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 SDR42E2A6NKP2 422 aa14.64□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 GABRR3A8MPY1 467 aa14.64□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 ADAM10O14672 748 aa14.64□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 FAM155BO75949 473 aa14.64□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 KRT14P02533 472 aa14.64□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 ZNF24P17028 368 aa14.64□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 IGFBP2P18065 325 aa14.64□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 VPS41P49754 854 aa14.64□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 CLCN7P51798 805 aa14.64□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 PNLIPRP1P54315 467 aa14.64□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 YBX1P67809 324 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 PTK6Q13882 451 aa14.64□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 TTLL9Q3SXZ7 439 aa14.64□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 CES4AQ5XG92 561 aa14.64□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 ZNF425Q6IV72 752 aa14.64□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 CASC4Q6P4E1 433 aa14.64□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 SUSD1Q6UWL2 747 aa14.64□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 C3P1Q6ZMU1 363 aa14.64□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 LANCL3Q6ZV70 420 aa14.64□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 LMNTD2Q8IXW0 634 aa14.64□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 LGI4Q8N135 537 aa14.64□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa14.64□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 OLFM1Q99784 485 aa14.64□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 ZNF559Q9BR84 538 aa14.64□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 LRFN1Q9P244 771 aa14.64□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 CTAGE9A4FU28 777 aa14.63□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 NSA2O95478 260 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 MPC1LP0DKB6 136 aa14.63□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 EFNA3P52797 238 aa14.63□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 ABATP80404 500 aa14.63□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 MAPKAPK3Q16644 382 aa14.63□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 ANKRD22Q5VYY1 191 aa14.63□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 ICE2Q659A1 982 aa14.63□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 ZNF470Q6ECI4 717 aa14.63□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 ANKRD37Q7Z713 158 aa14.63□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 TMEM200AQ86VY9 491 aa14.63□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 REXO1L1PQ8IX06 675 aa14.63□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 RASGEF1CQ8N431 466 aa14.63□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 AMER2Q8N7J2 671 aa14.63□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 POGLUT1Q8NBL1 392 aa14.63□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 KCNJ9Q92806 393 aa14.63□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 PKP4Q99569 1192 aa14.63□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 CCDC68Q9H2F9 335 aa14.63□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 KCNN3Q9UGI6 736 aa14.63□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 PCYOX1Q9UHG3 505 aa14.63□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 ASB1Q9Y576 335 aa14.63□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 COMMD10Q9Y6G5 202 aa14.63□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa14.62□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa14.62□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 E7ENX8 843 aa14.62□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 GFYI3L273 518 aa14.62□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 NEURL1O76050 574 aa14.62□□□□□ -0.07
CD4-210ENST00000541982 SLC16A8O95907 504 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.4 ms