RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520898.5

UBR5-208, Transcript of ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 5, human

TSL 3

Gene UBR5, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBR5-208	ENST00000520898	BLMH	Q13867	455 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	KRT31	Q15323	416 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	KYNU	Q16719	465 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	ZNF630	Q2M218	657 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	PTCHD3	Q3KNS1	767 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	CCDC38	Q502W7	563 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	ALS2CL	Q60I27	953 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	METRNL	Q641Q3	311 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	FJX1	Q86VR8	437 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	OOSP2	Q86WS3	158 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	ZNF527	Q8NB42	609 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	CLEC1A	Q8NC01	280 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	DTX3L	Q8TDB6	740 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	GRHL3	Q8TE85	626 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	TEKT4	Q8WW24	435 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	TM9SF4	Q92544	642 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	HSPH1	Q92598	858 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	ZNF566	Q969W8	418 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	IQCD	Q96DY2	449 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	TLR10	Q9BXR5	811 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	P4HTM	Q9NXG6	502 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	SLC24A2	Q9UI40	661 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	POMT2	Q9UKY4	750 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	PADI2	Q9Y2J8	665 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	OR6C74	A6NCV1	312 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	TMEM150C	B9EJG8	249 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898		C9J4A7	227 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	MASP2	O00187	686 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	PCDH17	O14917	1159 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	ZNF749	O43361	778 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	POP7	O75817	140 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	MT-ND5	P03915	603 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	UMOD	P07911	640 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	HBQ1	P09105	142 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	CD48	P09326	243 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	GZMA	P12544	262 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	FER	P16591	822 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	CYP2A7	P20853	494 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	CD86	P42081	329 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	TDGF1P3	P51864	188 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	CTSC	P53634	463 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	RAC3	P60763	192 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	RAP2B	P61225	183 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	POU6F2	P78424	691 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	MXRA7	P84157	204 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	DUSP8	Q13202	625 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	GALNT3	Q14435	633 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	BECN1	Q14457	450 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	NFE2L1	Q14494	772 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	FCRL6	Q6DN72	434 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	AMZ2	Q86W34	360 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	TRAPPC5	Q8IUR0	188 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	TMEM151B	Q8IW70	566 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	NEK11	Q8NG66	645 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	OR2Y1	Q8NGV0	311 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	NACC2	Q96BF6	587 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	TADA1	Q96BN2	335 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	PTER	Q96BW5	349 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	GBP5	Q96PP8	586 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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