RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 CCL21O00585 134 aa18.19■□□□□ 0.5
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SH3BP2-220ENST00000511663 AP1S2P56377 157 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-220ENST00000511663 OR4D2P58180 307 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-220ENST00000511663 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-220ENST00000511663 RGS1Q08116 209 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-220ENST00000511663 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-220ENST00000511663 PWP1Q13610 501 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP2-220ENST00000511663 CSHL1Q14406 222 aa18.15■□□□□ 0.5
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