RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491292.5

ERCC3-208, Transcript of ERCC excision repair 3, TFIIH core complex helicase subunit, humanhuman

TSL 2

Gene ERCC3, Length 4,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3-208ENST00000491292 FAM220BPB1ANY3 271 aa9.51□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 FAM227AF5H4B4 570 aa9.51□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 J3KTA2 159 aa9.51□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 AKR7A2O43488 359 aa9.51□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 MMP2P08253 660 aa9.51□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 DUSP4Q13115 394 aa9.51□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 SLC14A1Q13336 389 aa9.51□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 POM121L1PQ3SYA9 428 aa9.51□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 MZT2BQ6NZ67 158 aa9.51□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 LUZP2Q86TE4 346 aa9.51□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 OR6C4Q8NGE1 309 aa9.51□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa9.51□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 KLHL1Q9NR64 748 aa9.51□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 OSGIN1Q9UJX0 560 aa9.51□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 ANKDD1BA6NHY2 528 aa9.5□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 CLDN24A6NM45 220 aa9.5□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 PTCHD3Q3KNS1 767 aa9.5□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 SYTL3Q4VX76 610 aa9.5□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 LCN1P1Q5VSP4 162 aa9.5□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 BBS7Q8IWZ6 715 aa9.5□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 YIPF7Q8N8F6 280 aa9.5□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 IL17RDQ8NFM7 739 aa9.5□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 TP53INP1Q96A56 240 aa9.5□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 DUSP26Q9BV47 211 aa9.5□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 CD244Q9BZW8 370 aa9.5□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 TLR6Q9Y2C9 796 aa9.5□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 ADAMDEC1O15204 470 aa9.5□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 CNMDO75829 334 aa9.5□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 CLEC2LP0C7M8 214 aa9.5□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 ITGAMP11215 1152 aa9.5□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 LAMP1P11279 417 aa9.5□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 ACPPP15309 386 aa9.5□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 BCL2L1Q07817 233 aa9.5□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 LEXMQ3ZCV2 418 aa9.5□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 CTSL3PQ5NE16 218 aa9.5□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 LRRC66Q68CR7 880 aa9.5□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 ALKAL1Q6UXT8 129 aa9.5□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa9.5□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 SNX20Q7Z614 316 aa9.5□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 RBFAQ8N0V3 343 aa9.5□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 TCEANCQ8N8B7 351 aa9.5□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 SLC37A3Q8NCC5 494 aa9.5□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 KLHDC9Q8NEP7 349 aa9.5□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 NFKBIDQ8NI38 313 aa9.5□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 FAM129BQ96TA1 746 aa9.5□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 TRPC4Q9UBN4 977 aa9.5□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 TRAV6A0A075B6T7 132 aa9.5□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa9.5□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 HHLA1C9JL84 531 aa9.5□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 CXCL11O14625 94 aa9.5□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 PRAMEF10O60809 474 aa9.5□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 CLDN7O95471 211 aa9.5□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 PRKAR1AP10644 381 aa9.5□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 CNR2P34972 360 aa9.5□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 CAMK2BQ13554 666 aa9.5□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 KEAP1Q14145 624 aa9.5□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa9.5□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 UXS1Q8NBZ7 420 aa9.5□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 KCNJ9Q92806 393 aa9.5□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 KCNN1Q92952 543 aa9.5□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 ACPTQ9BZG2 426 aa9.5□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa9.5□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 ISM1B1AKI9 464 aa9.49□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 M0R082 166 aa9.49□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 PRAMEF11O60813 436 aa9.49□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 TOXO94900 526 aa9.49□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 CDK1P06493 297 aa9.49□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 ETFAP13804 333 aa9.49□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 CYP2A7P20853 494 aa9.49□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 PRKAG1P54619 331 aa9.49□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 RAB8AP61006 207 aa9.49□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 KCNC4Q03721 635 aa9.49□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 CACNG1Q06432 222 aa9.49□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 NAE1Q13564 534 aa9.49□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 GBX1Q14549 363 aa9.49□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 BAK1Q16611 211 aa9.49□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 DUOXA1Q1HG43 343 aa9.49□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 GPAT3Q53EU6 434 aa9.49□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 IFI44LQ53G44 452 aa9.49□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 RAB41Q5JT25 222 aa9.49□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 ANKS3Q6ZW76 656 aa9.49□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 SHFQ7M4L6 423 aa9.49□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 PHC2Q8IXK0 858 aa9.49□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 MSRB3Q8IXL7 192 aa9.49□□□□□ -0.89
ERCC3-208ENST00000491292 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms