RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490653.1

PRPF4B-208, Transcript of pre-mRNA processing factor 4B, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF4B, Length 581 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4B-208ENST00000490653 J3QW42 95 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 AGPSO00116 658 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 PEX12O00623 359 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 CES2O00748 559 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 ZSCAN12O43309 604 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 ZBTB14O43829 449 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 JRKO75564 520 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 TSPAN12O95859 305 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 B3GALT4O96024 378 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 IGLV1-40P01703 118 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 CATP04040 527 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 ZGLP1P0C6A0 271 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 PGAM1P18669 254 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 MMP11P24347 488 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 SOX18P35713 384 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 ITGA8P53708 1063 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 KLC1Q07866 573 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 NAE1Q13564 534 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 MYBPC3Q14896 1274 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 PHKG1Q16816 387 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 FAM214AQ32MH5 1076 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 CRB2Q5IJ48 1285 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 TCTE1Q5JU00 501 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 SPANXN3Q5MJ09 141 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 NEK10Q6ZWH5 1172 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 VN1R4Q7Z5H5 301 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 CTAGE6Q86UF2 777 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 CUZD1Q86UP6 607 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 AMER3Q8N944 861 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 CATSPER1Q8NEC5 780 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 OR11G2Q8NGC1 345 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 GRK7Q8WTQ7 553 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 CCDC68Q9H2F9 335 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 SMYD2Q9NRG4 433 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 ASF1BQ9NVP2 202 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 PADI2Q9Y2J8 665 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 SNX24Q9Y343 169 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 PSAT1Q9Y617 370 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 ESPL1Q14674 2120 aa6.95□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 A1L4Q6 167 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 PFDN6O15212 129 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 DPM1O60762 260 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 VPS26AO75436 327 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 WISP2O76076 250 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 TGFB1P01137 390 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 GHRHP01286 108 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 NPPBP16860 134 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 TCP1P17987 556 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 ITGA3P26006 1051 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 RPL21P46778 160 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 GLRBP48167 497 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 EMP2P54851 167 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 RRADP55042 308 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 SOX8P57073 446 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 CSNK1G2P78368 415 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF460Q14592 562 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 ARHGAP19Q14CB8 494 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 TRADDQ15628 312 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 RBBP7Q16576 425 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 TTLL9Q3SXZ7 439 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 HECTD2Q5U5R9 776 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 ATG9BQ674R7 924 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 UGT3A1Q6NUS8 523 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 LINC00696Q6ZRV3 163 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 ADCK2Q7Z695 626 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 RAB42Q8N4Z0 105 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 CSNK1A1LQ8N752 337 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 KCT2Q8NC54 265 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 OR9A4Q8NGU2 314 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 PSMF1Q92530 271 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 KCNJ9Q92806 393 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 SLCO2A1Q92959 643 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 FKBP10Q96AY3 582 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 MIEF2Q96C03 454 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 PYCR2Q96C36 320 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 MOCOSQ96EN8 888 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 LINGO1Q96FE5 620 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 CERS2Q96G23 380 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 PDLIM2Q96JY6 352 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 CABS1Q96KC9 395 aa6.94□□□□□ -1.3
PRPF4B-208ENST00000490653 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa6.94□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms