RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489763.1

TRBV12-2-201, Transcript of T cell receptor beta variable 12-2 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene TRBV12-2, Length 344 nt, Biotype TR V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV12-2-201ENST00000489763 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 IL3P08700 152 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 ERGP11308 486 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 HOXB2P14652 356 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 ATP6V1B1P15313 513 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 PPIBP23284 216 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 PSMB5P28074 263 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 PTPN6P29350 595 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 PKLRP30613 574 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 CTHP32929 405 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 SOAT1P35610 550 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 TRIM23P36406 574 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 RPL3P39023 403 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 CAPGP40121 348 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 PIK3CBP42338 1070 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 RPS9P46781 194 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 CCR8P51685 355 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 CLCN2P51788 898 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 ADPRHP54922 357 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 CLDN2P57739 230 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 TAS2R50P59544 299 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 PPP2CBP62714 309 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 PPP2CAP67775 309 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 REEP5Q00765 189 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 MC1RQ01726 317 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 VAC14Q08AM6 782 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 DMPKQ09013 629 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 ZNF763Q0D2J5 394 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 ABHD18Q0P651 414 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 MERTKQ12866 999 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 SLC14A1Q13336 389 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 GAB1Q13480 694 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 DAG1Q14118 895 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 SPIDRQ14159 915 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 ARHGAP19Q14CB8 494 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 CLCA4Q14CN2 919 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 AGERQ15109 404 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 RPE65Q16518 533 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 PRSS53Q2L4Q9 553 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 VMACQ2NL98 169 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 SLC36A3Q495N2 470 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 TMEM259Q4ZIN3 620 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 LIN52Q52LA3 116 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 PYCR3Q53H96 274 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 NHSL2Q5HYW2 709 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 FOXB2Q5VYV0 432 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 CPZQ66K79 652 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 ANKRD34AQ69YU3 496 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 FAM71E1Q6IPT2 247 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 KRT80Q6KB66 452 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 ERICH5Q6P6B1 374 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 ENPP7Q6UWV6 458 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 FKBP9P1Q75LS8 142 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 CAMKMTQ7Z624 323 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 ADCK2Q7Z695 626 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 SERPINA11Q86U17 422 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 SLC9B2Q86UD5 537 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 STK32CQ86UX6 486 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 FAM129CQ86XR2 697 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 PTOV1Q86YD1 416 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 MMP21Q8N119 569 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 ZNF786Q8N393 782 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 RAB42Q8N4Z0 105 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 DHRSXQ8N5I4 330 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 FAM47BQ8NA70 645 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 IL17RCQ8NAC3 791 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 VPS37AQ8NEZ2 397 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 OR4K1Q8NGD4 311 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 OR8J2Q8NGG1 315 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 OR52E4Q8NGH9 312 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 OR5K1Q8NHB7 308 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 TFAP2CQ92754 450 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 TMBIM1Q969X1 311 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 SDCCAG3Q96C92 435 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 PPCDCQ96CD2 204 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 COQ8BQ96D53 544 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 CXorf40BQ96DE9 158 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 SIPA1Q96FS4 1042 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 PYURFQ96I23 114 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 FBXL20Q96IG2 436 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 HHIPQ96QV1 700 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 OR2M4Q96R27 311 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 F2RL3Q96RI0 385 aa3.65□□□□□ -1.83
TRBV12-2-201ENST00000489763 GDF15Q99988 308 aa3.65□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.9 ms