RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489554.1

SCAMP4-208, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, human

TSL 3

Gene SCAMP4, Length 573 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCAMP4-208	ENST00000489554	EPOR	P19235	508 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	MAG	P20916	626 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	NAA25	Q14CX7	972 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	NCF4	Q15080	339 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	10.1	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	PFKFB4	Q16877	469 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	DEFB110	Q30KQ9	67 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	PTCHD3	Q3KNS1	767 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	UNC50	Q53HI1	259 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	ZNF678	Q5SXM1	525 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	HHAT	Q5VTY9	493 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	LCN10	Q6JVE6	187 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	RHBDD2	Q6NTF9	364 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	C2orf73	Q8N5S3	287 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	OR9A1P	Q8NGU1	263 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	OR56A3	Q8NH54	315 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	MCOLN3	Q8TDD5	553 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	CKAP2	Q8WWK9	683 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	ZUFSP	Q96AP4	578 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	PHF21B	Q96EK2	531 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	CCDC138	Q96M89	665 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	NSUN5	Q96P11	429 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	NDC1	Q9BTX1	674 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	C20orf27	Q9GZN8	174 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	GSTO2	Q9H4Y5	243 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	TXLNG	Q9NUQ3	528 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	ARL15	Q9NXU5	204 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	CD274	Q9NZQ7	290 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	ANAPC2	Q9UJX6	822 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	PCTP	Q9UKL6	214 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	TCFL5	Q9UL49	500 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	TLN1	Q9Y490	2541 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554		A0A1B0GTL3	188 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	WDR91	A4D1P6	747 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	ZNF839	A8K0R7	811 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554		E7ENX8	843 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	E2F3	O00716	465 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	HCRTR1	O43613	425 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	PRAMEF4	O60810	478 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	SMIM24	O75264	130 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	ANXA5	P08758	320 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	TAC1	P20366	129 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	IMPDH1	P20839	514 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	BGN	P21810	368 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	HSD17B2	P37059	387 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	GDF5	P43026	501 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	ARSF	P54793	590 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	DCD	P81605	110 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	TAP2	Q03519	686 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	IL10RA	Q13651	578 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	ARHGAP19	Q14CB8	494 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	PDK4	Q16654	411 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	CYP2A13	Q16696	494 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	TCTE1	Q5JU00	501 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	LIPM	Q5VYY2	423 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	SULT1C3	Q6IMI6	304 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	TCTN3	Q6NUS6	607 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	FIGLA	Q6QHK4	219 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	AGTRAP	Q6RW13	159 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	RGS9BP	Q6ZS82	235 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	FRA10AC1	Q70Z53	315 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	ZNF655	Q8N720	491 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	CCDC63	Q8NA47	563 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	PPFIBP2	Q8ND30	876 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	ADAMTS17	Q8TE56	1095 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	GBP5	Q96PP8	586 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	OR4K3	Q96R72	315 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	SGPP1	Q9BX95	441 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	ZNF395	Q9H8N7	513 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	GPN3	Q9UHW5	284 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	MID2	Q9UJV3	735 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	TMCO1	Q9UM00	188 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	KLHL20	Q9Y2M5	609 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	KLK4	Q9Y5K2	254 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	SNRNP200	O75643	2136 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SCAMP4-208	ENST00000489554	PPP6C	O00743	305 aa		10.08	□□□□□ -0.8

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