RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489157.5

TAPBP-241, Transcript of TAP binding protein, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TAPBP, Length 1,299 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAPBP-241ENST00000489157 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP13.35□□□□□ -0.27
TAPBP-241ENST00000489157 PARVBQ9HBI1 364 aa13.35□□□□□ -0.27
TAPBP-241ENST00000489157 TAS2R13Q9NYV9 303 aa13.35□□□□□ -0.27
TAPBP-241ENST00000489157 IKZF3Q9UKT9 509 aa13.35□□□□□ -0.27
TAPBP-241ENST00000489157 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa13.34□□□□□ -0.27
TAPBP-241ENST00000489157 A8MUI8 341 aa13.34□□□□□ -0.27
TAPBP-241ENST00000489157 H0YIG0 161 aa13.34□□□□□ -0.27
TAPBP-241ENST00000489157 ZG16O60844 167 aa13.34□□□□□ -0.27
TAPBP-241ENST00000489157 DNAJB6O75190 326 aa13.34□□□□□ -0.27
TAPBP-241ENST00000489157 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
TAPBP-241ENST00000489157 WISP2O76076 250 aa13.34□□□□□ -0.27
TAPBP-241ENST00000489157 B3GALT4O96024 378 aa13.34□□□□□ -0.27
TAPBP-241ENST00000489157 C8GP07360 202 aa13.34□□□□□ -0.27
TAPBP-241ENST00000489157 NPPBP16860 134 aa13.34□□□□□ -0.27
TAPBP-241ENST00000489157 FDXRP22570 491 aa13.34□□□□□ -0.27
TAPBP-241ENST00000489157 RGS4P49798 205 aa13.34□□□□□ -0.27
TAPBP-241ENST00000489157 PMP22Q01453 160 aa13.34□□□□□ -0.27
TAPBP-241ENST00000489157 ZNF33BQ06732 778 aa13.34□□□□□ -0.27
TAPBP-241ENST00000489157 SPANXN3Q5MJ09 141 aa13.34□□□□□ -0.27
TAPBP-241ENST00000489157 UGT3A1Q6NUS8 523 aa13.34□□□□□ -0.27
TAPBP-241ENST00000489157 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
TAPBP-241ENST00000489157 LCTLQ6UWM7 567 aa13.34□□□□□ -0.27
TAPBP-241ENST00000489157 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa13.34□□□□□ -0.27
TAPBP-241ENST00000489157 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
TAPBP-241ENST00000489157 ASPGQ86U10 573 aa13.34□□□□□ -0.27
TAPBP-241ENST00000489157 FJX1Q86VR8 437 aa13.34□□□□□ -0.27
TAPBP-241ENST00000489157 OR5T3Q8NGG3 340 aa13.34□□□□□ -0.27
TAPBP-241ENST00000489157 SLC13A3Q8WWT9 602 aa13.34□□□□□ -0.27
TAPBP-241ENST00000489157 METTL21AQ8WXB1 218 aa13.34□□□□□ -0.27
TAPBP-241ENST00000489157 CERS2Q96G23 380 aa13.34□□□□□ -0.27
TAPBP-241ENST00000489157 CFAP36Q96G28 342 aa13.34□□□□□ -0.27
TAPBP-241ENST00000489157 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
TAPBP-241ENST00000489157 TUBB6Q9BUF5 446 aa13.34□□□□□ -0.27
TAPBP-241ENST00000489157 SGPP1Q9BX95 441 aa13.34□□□□□ -0.27
TAPBP-241ENST00000489157 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa13.34□□□□□ -0.27
TAPBP-241ENST00000489157 TRAV17A0A0B4J275 112 aa13.33□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 CTAGE15A4D2H0 777 aa13.33□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 MAN1A2O60476 641 aa13.33□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 HRH2P25021 359 aa13.33□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 IVDP26440 423 aa13.33□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 MST1P26927 711 aa13.33□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 SP140Q13342 867 aa13.33□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 BTBD16Q32M84 506 aa13.33□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa13.33□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa13.33□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 ANKRD37Q7Z713 158 aa13.33□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 CTAGE6Q86UF2 777 aa13.33□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 CNTN4Q8IWV2 1026 aa13.33□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 PALM2Q8IXS6 379 aa13.33□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 GPATCH11Q8N954 259 aa13.33□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 MFSD9Q8NBP5 474 aa13.33□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 CAMKVQ8NCB2 501 aa13.33□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 ZNF740Q8NDX6 193 aa13.33□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 NR4A3Q92570 626 aa13.33□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 PEX11GQ96HA9 241 aa13.33□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 OR4K3Q96R72 315 aa13.33□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 OLFM1Q99784 485 aa13.33□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 PCBD2Q9H0N5 130 aa13.33□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 SPNS1Q9H2V7 528 aa13.33□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 ANKHQ9HCJ1 492 aa13.33□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 ARL15Q9NXU5 204 aa13.33□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 CHMP2BQ9UQN3 213 aa13.33□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 SAR1BQ9Y6B6 198 aa13.33□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 PKDREJQ9NTG1 2253 aa13.33□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 DCHS2Q6V1P9 2916 aa13.33□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 CACNA1CQ13936 2221 aa13.32□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 PCDH17O14917 1159 aa13.32□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 SLC16A5O15375 505 aa13.32□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 TTC4O95801 387 aa13.32□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 GUCA1CO95843 209 aa13.32□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 STSP08842 583 aa13.32□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 ELK3P41970 407 aa13.32□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 OLR1P78380 273 aa13.32□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 CATSPEREQ5SY80 951 aa13.32□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 HECTD2Q5U5R9 776 aa13.32□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 ABHD17BQ5VST6 288 aa13.32□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 KLHL7Q8IXQ5 586 aa13.32□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 BEST3Q8N1M1 668 aa13.32□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 TSLPQ969D9 159 aa13.32□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 THAP11Q96EK4 314 aa13.32□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 NPAS2Q99743 824 aa13.32□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 ANKRD10Q9NXR5 420 aa13.32□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 STMN3Q9NZ72 180 aa13.32□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 TACC2O95359 2948 aa13.31□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 OR5H15A6NDH6 313 aa13.31□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 NDUFS4O43181 175 aa13.31□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 OR1F1O43749 312 aa13.31□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 PRAMEF2O60811 474 aa13.31□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 SERPIND1P05546 499 aa13.31□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 ICAM2P13598 275 aa13.31□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 HIST1H2ADP20671 130 aa13.31□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 IL2P60568 153 aa13.31□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 RHAGQ02094 409 aa13.31□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 SFT2D3Q587I9 215 aa13.31□□□□□ -0.28
TAPBP-241ENST00000489157 PLAG1Q6DJT9 500 aa13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms