RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472027.1

SYN3-211, Transcript of synapsin III, humanhuman

TSL 4

Gene SYN3, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN3-211ENST00000472027 WWOXQ9NZC7 414 aa8.69□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 CD274Q9NZQ7 290 aa8.69□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 TRPC4Q9UBN4 977 aa8.69□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 ZFP69BQ9UJL9 534 aa8.69□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa8.69□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa8.69□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 MGAQ8IWI9 3026 aa8.69□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 ITPR1Q14643 2758 aa8.68□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 SGK494L7N484 410 aa8.68□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 NDUFS4O43181 175 aa8.68□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 STK16O75716 305 aa8.68□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 CEACAM4O75871 244 aa8.68□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 IPO13O94829 963 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 KLHL2O95198 593 aa8.68□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 NSA2O95478 260 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 PDGFAP04085 211 aa8.68□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 S100BP04271 92 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 SERPIND1P05546 499 aa8.68□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 INHBAP08476 426 aa8.68□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 FAM153BP0C7A2 387 aa8.68□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 IL1RNP18510 177 aa8.68□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 CXCR2P25025 360 aa8.68□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 AHRP35869 848 aa8.68□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 MSH2P43246 934 aa8.68□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 SERPINB8P50452 374 aa8.68□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 SERPINB9P50453 376 aa8.68□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 EMP2P54851 167 aa8.68□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 REEP5Q00765 189 aa8.68□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 CDC16Q13042 620 aa8.68□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 PWP1Q13610 501 aa8.68□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 ACAP2Q15057 778 aa8.68□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 RBBP7Q16576 425 aa8.68□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 FAM83EQ2M2I3 478 aa8.68□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 FAM153CQ494X1 144 aa8.68□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 DCAF10Q5QP82 559 aa8.68□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 ATG9BQ674R7 924 aa8.68□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 KIRREL2Q6UWL6 708 aa8.68□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa8.68□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 ASB18Q6ZVZ8 466 aa8.68□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
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SYN3-211ENST00000472027 SHISA5Q8N114 240 aa8.68□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 ANKRD53Q8N9V6 530 aa8.68□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 CLEC1AQ8NC01 280 aa8.68□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 TRPV3Q8NET8 790 aa8.68□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 OR51Q1Q8NH59 317 aa8.68□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 RHEBL1Q8TAI7 183 aa8.68□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa8.68□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 NT5CQ8TCD5 201 aa8.68□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 PAFAH2Q99487 392 aa8.68□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 CD244Q9BZW8 370 aa8.68□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 VPS11Q9H270 941 aa8.68□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 L2HGDHQ9H9P8 463 aa8.68□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 ANKHQ9HCJ1 492 aa8.68□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa8.68□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 DNAJC11Q9NVH1 559 aa8.68□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 GPRC5BQ9NZH0 403 aa8.68□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 C3orf18Q9UK00 162 aa8.68□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa8.68□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 SLC22A7Q9Y694 548 aa8.68□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 IKBKGQ9Y6K9 419 aa8.68□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 PCSK5Q92824 1860 aa8.68□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 SYCE1LA8MT33 242 aa8.67□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 IDSB3KWA1 339 aa8.67□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 SUPT3HB4E1H0 165 aa8.67□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 UBXN8O00124 270 aa8.67□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 MAP2K7O14733 419 aa8.67□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 CLGNO14967 610 aa8.67□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 RIPK2O43353 540 aa8.67□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 SLC28A2O43868 658 aa8.67□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 PRAMEF4O60810 478 aa8.67□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 KERAO60938 352 aa8.67□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 SUPT3HO75486 399 aa8.67□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 BMP10O95393 424 aa8.67□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 HEXBP07686 556 aa8.67□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 MTHFD2P13995 350 aa8.67□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 PLA2G2AP14555 144 aa8.67□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 GLRBP48167 497 aa8.67□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 PGDP52209 483 aa8.67□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 SOX8P57073 446 aa8.67□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 RGS1Q08116 209 aa8.67□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 HYAL2Q12891 473 aa8.67□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 KLRB1Q12918 225 aa8.67□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 RAPSNQ13702 412 aa8.67□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 TUBB8Q3ZCM7 444 aa8.67□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa8.67□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 KLC3Q6P597 504 aa8.67□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa8.67□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 PDSS2Q86YH6 399 aa8.67□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 KRT78Q8N1N4 520 aa8.67□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
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