RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460308.6

ABCD4-202, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ABCD4, Length 1,003 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-202ENST00000460308 TRPV3Q8NET8 790 aa20.37■□□□□ 0.85
ABCD4-202ENST00000460308 SLC39A7Q92504 469 aa20.37■□□□□ 0.85
ABCD4-202ENST00000460308 SLC26A1Q9H2B4 701 aa20.37■□□□□ 0.85
ABCD4-202ENST00000460308 SPNS1Q9H2V7 528 aa20.37■□□□□ 0.85
ABCD4-202ENST00000460308 WDR54Q9H977 334 aa20.37■□□□□ 0.85
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF358Q9NW07 568 aa20.37■□□□□ 0.85
ABCD4-202ENST00000460308 OPTCQ9UBM4 332 aa20.37■□□□□ 0.85
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ABCD4-202ENST00000460308 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
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ABCD4-202ENST00000460308 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP20.36■□□□□ 0.85
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ABCD4-202ENST00000460308 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
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ABCD4-202ENST00000460308 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
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ABCD4-202ENST00000460308 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
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ABCD4-202ENST00000460308 H0YIG0 161 aa20.34■□□□□ 0.85
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ABCD4-202ENST00000460308 POLE2P56282 527 aa20.34■□□□□ 0.85
ABCD4-202ENST00000460308 CHIT1Q13231 466 aa20.34■□□□□ 0.85
ABCD4-202ENST00000460308 DOC2AQ14183 400 aa20.34■□□□□ 0.85
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ABCD4-202ENST00000460308 SETDB1Q15047 1291 aa20.34■□□□□ 0.85
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ABCD4-202ENST00000460308 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa20.34■□□□□ 0.85
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ABCD4-202ENST00000460308 NT5CQ8TCD5 201 aa20.34■□□□□ 0.85
ABCD4-202ENST00000460308 STT3BQ8TCJ2 826 aa20.34■□□□□ 0.85
ABCD4-202ENST00000460308 ACMSDQ8TDX5 336 aa20.34■□□□□ 0.85
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ABCD4-202ENST00000460308 MOCOSQ96EN8 888 aa20.34■□□□□ 0.85
ABCD4-202ENST00000460308 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
ABCD4-202ENST00000460308 EFCAB11Q9BUY7 163 aa20.34■□□□□ 0.85
ABCD4-202ENST00000460308 NT5DC2Q9H857 520 aa20.34■□□□□ 0.85
ABCD4-202ENST00000460308 XPR1Q9UBH6 696 aa20.34■□□□□ 0.85
ABCD4-202ENST00000460308 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa20.34■□□□□ 0.85
ABCD4-202ENST00000460308 ASB1Q9Y576 335 aa20.34■□□□□ 0.85
ABCD4-202ENST00000460308 ANKDD1BA6NHY2 528 aa20.33■□□□□ 0.85
ABCD4-202ENST00000460308 ARGFXA6NJG6 315 aa20.33■□□□□ 0.85
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