RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449757.5

DDX39B-211, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 3

Gene DDX39B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-211ENST00000449757 LRFN1Q9P244 771 aa9.71□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF835Q9Y2P0 537 aa9.71□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 NAV3Q8IVL0 2385 aa9.71□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF407Q9C0G0 2248 aa9.7□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 CTAGE9A4FU28 777 aa9.7□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 ASPDHA6ND91 283 aa9.7□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 FAM90A27PA6NNH2 459 aa9.7□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 E7ENX8 843 aa9.7□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 NDC80O14777 642 aa9.7□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 TFECO14948 347 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 ASNA1O43681 348 aa9.7□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP9.7□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 SLC25A12O75746 678 aa9.7□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 TPOP07202 933 aa9.7□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 SP1P08047 785 aa9.7□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 CYC1P08574 325 aa9.7□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 PAMP19021 973 aa9.7□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 ARNTP27540 789 aa9.7□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 RPL22P35268 128 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 NPY2RP49146 381 aa9.7□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 OR4D2P58180 307 aa9.7□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 TBPL1P62380 186 aa9.7□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 TAP2Q03519 686 aa9.7□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 USP10Q14694 798 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 NSDHLQ15738 373 aa9.7□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 TYSND1Q2T9J0 566 aa9.7□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 SLC25A25Q6KCM7 469 aa9.7□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 CD163Q86VB7 1156 aa9.7□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 CYP4X1Q8N118 509 aa9.7□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 C14orf79Q96F83 325 aa9.7□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 PEX11GQ96HA9 241 aa9.7□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 HES6Q96HZ4 224 aa9.7□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 NPAS2Q99743 824 aa9.7□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 SPOCK3Q9BQ16 436 aa9.7□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 CDCP1Q9H5V8 836 aa9.7□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 MCCC2Q9HCC0 563 aa9.7□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 MMP25Q9NPA2 562 aa9.7□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa9.7□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa9.7□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 FEZF1A0PJY2 475 aa9.69□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 E9PLN8 166 aa9.69□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 AP3B1O00203 1094 aa9.69□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 ZBTB14O43829 449 aa9.69□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 KIF5CO60282 957 aa9.69□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 NADKO95544 446 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 SERPIND1P05546 499 aa9.69□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 OGNP20774 298 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 IMPA1P29218 277 aa9.69□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 PTGER1P34995 402 aa9.69□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 COILP38432 576 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 RFC3P40938 356 aa9.69□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 BCL6P41182 706 aa9.69□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 AKAP6Q13023 2319 aa9.69□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF470Q6ECI4 717 aa9.69□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 CEP128Q6ZU80 1094 aa9.69□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 VN1R4Q7Z5H5 301 aa9.69□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 ASPGQ86U10 573 aa9.69□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 TMEM200AQ86VY9 491 aa9.69□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 SPNS2Q8IVW8 549 aa9.69□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 SIAH3Q8IW03 269 aa9.69□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 KIF2BQ8N4N8 673 aa9.69□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 PRELID2Q8N945 189 aa9.69□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 CAMKVQ8NCB2 501 aa9.69□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 TMEM125Q96AQ2 219 aa9.69□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 TCF12Q99081 682 aa9.69□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 SLC30A3Q99726 388 aa9.69□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 VKORC1Q9BQB6 163 aa9.69□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 TRIM51Q9BSJ1 452 aa9.69□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 TMEM184CQ9NVA4 438 aa9.69□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 SAMD15Q9P1V8 674 aa9.69□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 SOX13Q9UN79 622 aa9.69□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa9.69□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa9.69□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 NME2P1O60361 137 aa9.68□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 NEURL1O76050 574 aa9.68□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 SLC35G6P0C7Q6 338 aa9.68□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 MPC1LP0DKB6 136 aa9.68□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 NME2P22392 152 aa9.68□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 GRK3P35626 688 aa9.68□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 VPS41P49754 854 aa9.68□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 MEOX1P50221 254 aa9.68□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 CLCN7P51798 805 aa9.68□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 ART1P52961 327 aa9.68□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 SLC26A5P58743 744 aa9.68□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 OLR1P78380 273 aa9.68□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 RHAGQ02094 409 aa9.68□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 RELAQ04206 551 aa9.68□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 TESK1Q15569 626 aa9.68□□□□□ -0.86
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms