RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 FOXL2P58012 376 aa11.11□□□□□ -0.63
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PRAME-210ENST00000442481 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
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PRAME-210ENST00000442481 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
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PRAME-210ENST00000442481 SLC26A11Q86WA9 606 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-210ENST00000442481 PPM1NQ8N819 430 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-210ENST00000442481 OR2L3Q8NG85 312 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-210ENST00000442481 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
PRAME-210ENST00000442481 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
PRAME-210ENST00000442481 ASB11Q8WXH4 323 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-210ENST00000442481 SMPDL3AQ92484 453 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-210ENST00000442481 HAS2Q92819 552 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-210ENST00000442481 CCDC77Q9BR77 488 aa11.09□□□□□ -0.63
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