RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 H3BM21 787 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 ARVCFO00192 962 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 BRINP1O60477 761 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 CSF3P09919 207 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 ITGALP20701 1170 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 CPN2P22792 545 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 GPR85P60893 370 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 RPP38P78345 283 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 PDZK1Q5T2W1 519 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 HECTD2Q5U5R9 776 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 ANKRD54Q6NXT1 300 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 ZFAND4Q86XD8 727 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 ATG16L2Q8NAA4 619 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 OR52H1Q8NGJ2 320 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 OR2T11Q8NH01 316 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 CYP2S1Q96SQ9 504 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 CNPPD1Q9BV87 410 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 ELOVL7A1L3X0 281 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM72CH0Y354 149 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 HBP1O60381 514 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 FCER2P06734 321 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 ERCC2P18074 760 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 MED22Q15528 200 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 GRIK4Q16099 956 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 TSTQ16762 297 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM72AQ5TYM5 149 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 CACHD1Q5VU97 1274 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM72DQ6L9T8 149 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM72BQ86X60 149 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 PHACTR4Q8IZ21 702 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 NPWQ8N729 165 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 C7orf31Q8N865 590 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM149B1Q96BN6 582 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 KIF12Q96FN5 646 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 HPDLQ96IR7 371 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 HYLS1Q96M11 299 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 HBEGFQ99075 208 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 APOL5Q9BWW9 433 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 NT5C1AQ9BXI3 368 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 BARHL1Q9BZE3 327 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 SERHL2Q9H4I8 314 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 ASB7Q9H672 318 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 C3orf14Q9HBI5 128 aa8.12□□□□□ -1.11
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RABGEF1-203ENST00000439720 KRT84Q9NSB2 600 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 SNTG1Q9NSN8 517 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 ABCG2Q9UNQ0 655 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 ERVW-1Q9UQF0 538 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A075B6Q4 140 aa8.12□□□□□ -1.11
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RABGEF1-203ENST00000439720 PLA2G10O15496 165 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 PMPCBO75439 489 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 RFPL3O75679 317 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 PDE9AO76083 593 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 GOSR1O95249 250 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 MLYCDO95822 493 aa8.12□□□□□ -1.11
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RABGEF1-203ENST00000439720 CHMP24386 653 aa8.12□□□□□ -1.11
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RABGEF1-203ENST00000439720 GPR68Q15743 365 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 XKR4Q5GH76 650 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 EEF1DP3Q658K8 133 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 KDM4DQ6B0I6 523 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 NADSYN1Q6IA69 706 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 RAB12Q6IQ22 244 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 GCNT7Q6ZNI0 430 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 GPAT4Q86UL3 456 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 TAGAPQ8N103 731 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 DPP10Q8N608 796 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC22A8Q8TCC7 542 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC35F5Q8WV83 523 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 GGHQ92820 318 aa8.12□□□□□ -1.11
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