RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR1D5P58170 312 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 E2F1Q01094 437 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 TLE3Q04726 772 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 MPP3Q13368 585 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 NFATC2Q13469 925 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 OLIG2Q13516 323 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 CYP1B1Q16678 543 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 NKAIN2Q5VXU1 208 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 LIN54Q6MZP7 749 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 PNCKQ6P2M8 343 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 MFSD7Q6UXD7 560 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 VASH2Q86V25 355 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 GALNT13Q8IUC8 556 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 RASGRP3Q8IV61 690 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAP7D3Q8IWC1 876 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC25A41Q8N5S1 370 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANKRD42Q8N9B4 389 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 TC2NQ8N9U0 490 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPC24Q8NBT2 197 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 IPMKQ8NFU5 416 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR1N1Q8NGS0 311 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARRDC2Q8TBH0 407 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 KIAA1524Q8TCG1 905 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC37A2Q8TED4 501 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 ABHD5Q8WTS1 349 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 PIH1D2Q8WWB5 315 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 CTHRC1Q96CG8 243 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 GRAMD1AQ96CP6 724 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 OLFM3Q96PB7 478 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 RNF157Q96PX1 679 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 APOL2Q9BQE5 337 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 DESI2Q9BSY9 194 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPATA16Q9BXB7 569 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 HEMGNQ9BXL5 484 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 GSDMCQ9BYG8 508 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 USP29Q9HBJ7 922 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 BPIFA1Q9NP55 256 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 THSD1Q9NS62 852 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 HAUS2Q9NVX0 235 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 PKD2L2Q9NZM6 624 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 FOXJ2Q9P0K8 574 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM9Q9P0T7 183 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 TAAR2Q9P1P5 351 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRIM10Q9UDY6 481 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 LOXL2Q9Y4K0 774 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 MED13Q9UHV7 2174 aa4.34□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 RELNP78509 3460 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A087WV48 116 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A1W2PQ67 120 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 A8MU76 341 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 J3KTA2 159 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 PSMD11O00231 422 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCL22O00626 93 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 CST8O60676 142 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 MTA2O94776 668 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 NXPH3O95157 252 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 ONECUT2O95948 504 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 FTCDO95954 541 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 VIPP01282 170 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 PTMAP06454 111 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 CDK4P11802 303 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF30P17039 623 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCNCP24863 283 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 PTPN3P26045 913 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 RBL1P28749 1068 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 GRIA3P42263 894 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAGEA1P43355 309 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 AVPR1BP47901 424 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPINT3P49223 89 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF75DP51815 510 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMPRSS3P57727 454 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 ABHD18Q0P651 414 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 C16orf72Q14CZ0 275 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 PDK1Q15118 436 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPA17Q15506 151 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 TGIF1Q15583 401 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms