RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF763Q0D2J5 394 aa22.28■■□□□ 1.16
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FAAP20-209ENST00000428120 SMPDL3AQ92484 453 aa22.28■■□□□ 1.16
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FAAP20-209ENST00000428120 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa22.26■■□□□ 1.15
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FAAP20-209ENST00000428120 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa22.26■■□□□ 1.15
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FAAP20-209ENST00000428120 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
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FAAP20-209ENST00000428120 TPRG1LQ5T0D9 272 aa22.26■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 PLD3Q8IV08 490 aa22.26■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 SCML1Q9UN30 329 aa22.26■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa22.25■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 KLHL33A6NCF5 533 aa22.25■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 AXIN1O15169 862 aa22.25■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 CREG1O75629 220 aa22.25■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 KLHL18O94889 574 aa22.25■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 EPN2O95208 641 aa22.25■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 HSD17B2P37059 387 aa22.25■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 TAS2R50P59544 299 aa22.25■■□□□ 1.15
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FAAP20-209ENST00000428120 CHRNB3Q05901 458 aa22.25■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 ABHD18Q0P651 414 aa22.25■■□□□ 1.15
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FAAP20-209ENST00000428120 ADCK2Q7Z695 626 aa22.25■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 METTL4Q8N3J2 472 aa22.25■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP22.25■■□□□ 1.15
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FAAP20-209ENST00000428120 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 AIF1LQ9BQI0 150 aa22.25■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 SPATA7Q9P0W8 599 aa22.25■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 AP3M1Q9Y2T2 418 aa22.25■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 KNL1Q8NG31 2342 aa22.25■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
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FAAP20-209ENST00000428120 SERPINA1P01009 418 aa22.24■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 CCR8P51685 355 aa22.24■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 COL19A1Q14993 1142 aa22.24■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 ENPP7Q6UWV6 458 aa22.24■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 CHRDL2Q6WN34 429 aa22.24■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 USP30Q70CQ3 517 aa22.24■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 MMP21Q8N119 569 aa22.24■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 C16orf78Q8WTQ4 265 aa22.24■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 F2RL3Q96RI0 385 aa22.24■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 CAAP1Q9H8G2 361 aa22.24■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 RAB28P51157 221 aa22.24■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 C2orf80Q0P641 193 aa22.24■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 GAB1Q13480 694 aa22.24■■□□□ 1.15
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