RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM53BQ14153 422 aa23.75■■□□□ 1.39
HTATSF1-202ENST00000425695 SYT16Q17RD7 645 aa23.75■■□□□ 1.39
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM83EQ2M2I3 478 aa23.75■■□□□ 1.39
HTATSF1-202ENST00000425695 CDKL4Q5MAI5 379 aa23.75■■□□□ 1.39
HTATSF1-202ENST00000425695 TAOK1Q7L7X3 1001 aa23.75■■□□□ 1.39
HTATSF1-202ENST00000425695 PRSS41Q7RTY9 318 aa23.75■■□□□ 1.39
HTATSF1-202ENST00000425695 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa23.75■■□□□ 1.39
HTATSF1-202ENST00000425695 CCDC91Q7Z6B0 441 aa23.75■■□□□ 1.39
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HTATSF1-202ENST00000425695 MIEF2Q96C03 454 aa23.75■■□□□ 1.39
HTATSF1-202ENST00000425695 ATOH8Q96SQ7 321 aa23.75■■□□□ 1.39
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HTATSF1-202ENST00000425695 PEX12O00623 359 aa23.74■■□□□ 1.39
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HTATSF1-202ENST00000425695 SLC35G6P0C7Q6 338 aa23.74■■□□□ 1.39
HTATSF1-202ENST00000425695 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa23.74■■□□□ 1.39
HTATSF1-202ENST00000425695 MYBL2P10244 700 aa23.74■■□□□ 1.39
HTATSF1-202ENST00000425695 IL1RNP18510 177 aa23.74■■□□□ 1.39
HTATSF1-202ENST00000425695 NR1D1P20393 614 aa23.74■■□□□ 1.39
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HTATSF1-202ENST00000425695 P4HTMQ9NXG6 502 aa23.74■■□□□ 1.39
HTATSF1-202ENST00000425695 NUDT4Q9NZJ9 180 aa23.74■■□□□ 1.39
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HTATSF1-202ENST00000425695 KLHL2O95198 593 aa23.73■■□□□ 1.39
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HTATSF1-202ENST00000425695 KLC1Q07866 573 aa23.73■■□□□ 1.39
HTATSF1-202ENST00000425695 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
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HTATSF1-202ENST00000425695 CRB3Q9BUF7 120 aa23.73■■□□□ 1.39
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HTATSF1-202ENST00000425695 SGK494L7N484 410 aa23.72■■□□□ 1.39
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HTATSF1-202ENST00000425695 MED25Q71SY5 747 aa23.72■■□□□ 1.39
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HTATSF1-202ENST00000425695 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
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HTATSF1-202ENST00000425695 CD244Q9BZW8 370 aa23.72■■□□□ 1.39
HTATSF1-202ENST00000425695 ANKHQ9HCJ1 492 aa23.72■■□□□ 1.39
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF180Q9UJW8 692 aa23.72■■□□□ 1.39
HTATSF1-202ENST00000425695 C3orf18Q9UK00 162 aa23.72■■□□□ 1.39
HTATSF1-202ENST00000425695 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa23.72■■□□□ 1.39
HTATSF1-202ENST00000425695 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa23.72■■□□□ 1.39
HTATSF1-202ENST00000425695 CLGNO14967 610 aa23.71■■□□□ 1.39
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
HTATSF1-202ENST00000425695 AHRP35869 848 aa23.71■■□□□ 1.39
HTATSF1-202ENST00000425695 RGS1Q08116 209 aa23.71■■□□□ 1.39
HTATSF1-202ENST00000425695 PWP1Q13610 501 aa23.71■■□□□ 1.39
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HTATSF1-202ENST00000425695 SLC29A2Q14542 456 aa23.71■■□□□ 1.39
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HTATSF1-202ENST00000425695 GPR78Q96P69 363 aa23.71■■□□□ 1.39
HTATSF1-202ENST00000425695 MESP1Q9BRJ9 268 aa23.71■■□□□ 1.39
HTATSF1-202ENST00000425695 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
HTATSF1-202ENST00000425695 GPRC5BQ9NZH0 403 aa23.71■■□□□ 1.39
HTATSF1-202ENST00000425695 HCN3Q9P1Z3 774 aa23.71■■□□□ 1.39
HTATSF1-202ENST00000425695 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa23.71■■□□□ 1.39
HTATSF1-202ENST00000425695 SPTA1P02549 2419 aa23.7■■□□□ 1.38
HTATSF1-202ENST00000425695 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa23.7■■□□□ 1.38
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF860A6NHJ4 632 aa23.7■■□□□ 1.38
HTATSF1-202ENST00000425695 SYCE1LA8MT33 242 aa23.7■■□□□ 1.38
HTATSF1-202ENST00000425695 B8ZZF3 427 aa23.7■■□□□ 1.38
HTATSF1-202ENST00000425695 MAP2K7O14733 419 aa23.7■■□□□ 1.38
HTATSF1-202ENST00000425695 PRAMEF4O60810 478 aa23.7■■□□□ 1.38
HTATSF1-202ENST00000425695 NSA2O95478 260 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
HTATSF1-202ENST00000425695 B3GALT4O96024 378 aa23.7■■□□□ 1.38
HTATSF1-202ENST00000425695 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
HTATSF1-202ENST00000425695 MTHFD2P13995 350 aa23.7■■□□□ 1.38
HTATSF1-202ENST00000425695 CXCR2P25025 360 aa23.7■■□□□ 1.38
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