RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421832.2

CTU1-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTU1, Length 2,087 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1-201ENST00000421832 ACTR1AP61163 376 aa23.54■■□□□ 1.36
CTU1-201ENST00000421832 LCP2Q13094 533 aa23.54■■□□□ 1.36
CTU1-201ENST00000421832 GTF2H2Q13888 395 aa23.54■■□□□ 1.36
CTU1-201ENST00000421832 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
CTU1-201ENST00000421832 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa23.54■■□□□ 1.36
CTU1-201ENST00000421832 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa23.54■■□□□ 1.36
CTU1-201ENST00000421832 ZUFSPQ96AP4 578 aa23.54■■□□□ 1.36
CTU1-201ENST00000421832 MID1IP1Q9NPA3 183 aa23.54■■□□□ 1.36
CTU1-201ENST00000421832 MYO15AQ9UKN7 3530 aa23.54■■□□□ 1.36
CTU1-201ENST00000421832 TRPC5OSA6NMA1 111 aa23.53■■□□□ 1.36
CTU1-201ENST00000421832 E7ENX8 843 aa23.53■■□□□ 1.36
CTU1-201ENST00000421832 TLR4O00206 839 aa23.53■■□□□ 1.36
CTU1-201ENST00000421832 STK16O75716 305 aa23.53■■□□□ 1.36
CTU1-201ENST00000421832 CPNE6O95741 557 aa23.53■■□□□ 1.36
CTU1-201ENST00000421832 JUNP05412 331 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
CTU1-201ENST00000421832 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
CTU1-201ENST00000421832 LRP8Q14114 963 aa23.53■■□□□ 1.36
CTU1-201ENST00000421832 UAP1L1Q3KQV9 507 aa23.53■■□□□ 1.36
CTU1-201ENST00000421832 CLEC6AQ6EIG7 209 aa23.53■■□□□ 1.36
CTU1-201ENST00000421832 AGTRAPQ6RW13 159 aa23.53■■□□□ 1.36
CTU1-201ENST00000421832 PARGQ86W56 976 aa23.53■■□□□ 1.36
CTU1-201ENST00000421832 FAM156AQ8NDB6 213 aa23.53■■□□□ 1.36
CTU1-201ENST00000421832 CDK15Q96Q40 435 aa23.53■■□□□ 1.36
CTU1-201ENST00000421832 KCNA7Q96RP8 456 aa23.53■■□□□ 1.36
CTU1-201ENST00000421832 C9orf16Q9BUW7 83 aa23.53■■□□□ 1.36
CTU1-201ENST00000421832 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
CTU1-201ENST00000421832 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
CTU1-201ENST00000421832 OPTCQ9UBM4 332 aa23.53■■□□□ 1.36
CTU1-201ENST00000421832 DLGAP1O14490 977 aa23.53■■□□□ 1.36
CTU1-201ENST00000421832 CLPXO76031 633 aa23.53■■□□□ 1.36
CTU1-201ENST00000421832 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
CTU1-201ENST00000421832 HNMTP50135 292 aa23.53■■□□□ 1.36
CTU1-201ENST00000421832 FOXA1P55317 472 aa23.53■■□□□ 1.36
CTU1-201ENST00000421832 RBBP7Q16576 425 aa23.53■■□□□ 1.36
CTU1-201ENST00000421832 LINC00299Q6ZSB3 139 aa23.53■■□□□ 1.36
CTU1-201ENST00000421832 OR5K2Q8NHB8 316 aa23.53■■□□□ 1.36
CTU1-201ENST00000421832 FAM174AQ8TBP5 190 aa23.53■■□□□ 1.36
CTU1-201ENST00000421832 ZNF480Q8WV37 535 aa23.53■■□□□ 1.36
CTU1-201ENST00000421832 TAMM41Q96BW9 452 aa23.53■■□□□ 1.36
CTU1-201ENST00000421832 IL17FQ96PD4 163 aa23.53■■□□□ 1.36
CTU1-201ENST00000421832 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
CTU1-201ENST00000421832 SPAG4Q9NPE6 437 aa23.53■■□□□ 1.36
CTU1-201ENST00000421832 OR7A17O14581 309 aa23.52■■□□□ 1.36
CTU1-201ENST00000421832 HRO43593 1189 aa23.52■■□□□ 1.36
CTU1-201ENST00000421832 BCL10O95999 233 aa23.52■■□□□ 1.36
CTU1-201ENST00000421832 EPORP19235 508 aa23.52■■□□□ 1.36
CTU1-201ENST00000421832 SYVN1Q86TM6 617 aa23.52■■□□□ 1.36
CTU1-201ENST00000421832 PHACTR4Q8IZ21 702 aa23.52■■□□□ 1.36
CTU1-201ENST00000421832 OR9A1PQ8NGU1 263 aa23.52■■□□□ 1.36
CTU1-201ENST00000421832 ZNF347Q96SE7 839 aa23.52■■□□□ 1.36
CTU1-201ENST00000421832 PCDHAC1Q9H158 963 aa23.52■■□□□ 1.36
CTU1-201ENST00000421832 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
CTU1-201ENST00000421832 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
CTU1-201ENST00000421832 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa23.52■■□□□ 1.35
CTU1-201ENST00000421832 CKMT2P17540 419 aa23.52■■□□□ 1.35
CTU1-201ENST00000421832 C1orf61Q13536 156 aa23.52■■□□□ 1.35
CTU1-201ENST00000421832 CYP2A13Q16696 494 aa23.52■■□□□ 1.35
CTU1-201ENST00000421832 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa23.52■■□□□ 1.35
CTU1-201ENST00000421832 NXNQ6DKJ4 435 aa23.52■■□□□ 1.35
CTU1-201ENST00000421832 IQCHQ86VS3 1027 aa23.52■■□□□ 1.35
CTU1-201ENST00000421832 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa23.52■■□□□ 1.35
CTU1-201ENST00000421832 TCAIMQ8N3R3 496 aa23.52■■□□□ 1.35
CTU1-201ENST00000421832 OR13F1Q8NGS4 319 aa23.52■■□□□ 1.35
CTU1-201ENST00000421832 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.35
CTU1-201ENST00000421832 IPPKQ9H8X2 491 aa23.52■■□□□ 1.35
CTU1-201ENST00000421832 SLC22A14Q9Y267 594 aa23.52■■□□□ 1.35
CTU1-201ENST00000421832 WDR47O94967 919 aa23.51■■□□□ 1.35
CTU1-201ENST00000421832 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
CTU1-201ENST00000421832 ITGADQ13349 1161 aa23.51■■□□□ 1.35
CTU1-201ENST00000421832 NAE1Q13564 534 aa23.51■■□□□ 1.35
CTU1-201ENST00000421832 RPE65Q16518 533 aa23.51■■□□□ 1.35
CTU1-201ENST00000421832 PMS2CLQ68D20 193 aa23.51■■□□□ 1.35
CTU1-201ENST00000421832 KCTD8Q6ZWB6 473 aa23.51■■□□□ 1.35
CTU1-201ENST00000421832 IGFN1Q86VF2 1251 aa23.51■■□□□ 1.35
CTU1-201ENST00000421832 DHFR2Q86XF0 187 aa23.51■■□□□ 1.35
CTU1-201ENST00000421832 SFTPA2Q8IWL1 248 aa23.51■■□□□ 1.35
CTU1-201ENST00000421832 FBXL6Q8N531 539 aa23.51■■□□□ 1.35
CTU1-201ENST00000421832 GPBAR1Q8TDU6 330 aa23.51■■□□□ 1.35
CTU1-201ENST00000421832 PPP1R36Q96LQ0 422 aa23.51■■□□□ 1.35
CTU1-201ENST00000421832 FERD3LQ96RJ6 166 aa23.51■■□□□ 1.35
CTU1-201ENST00000421832 SLC32A1Q9H598 525 aa23.51■■□□□ 1.35
CTU1-201ENST00000421832 TMEM181Q9P2C4 612 aa23.51■■□□□ 1.35
CTU1-201ENST00000421832 CORINQ9Y5Q5 1042 aa23.51■■□□□ 1.35
CTU1-201ENST00000421832 FRYLO94915 3013 aa23.51■■□□□ 1.35
CTU1-201ENST00000421832 A6NCN8 305 aa23.5■■□□□ 1.35
CTU1-201ENST00000421832 J3QRK9 145 aa23.5■■□□□ 1.35
CTU1-201ENST00000421832 PI4KAP42356 2102 aa23.5■■□□□ 1.35
CTU1-201ENST00000421832 HLCSP50747 726 aa23.5■■□□□ 1.35
CTU1-201ENST00000421832 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
CTU1-201ENST00000421832 ZNF846Q147U1 533 aa23.5■■□□□ 1.35
CTU1-201ENST00000421832 WDR45BQ5MNZ6 344 aa23.5■■□□□ 1.35
CTU1-201ENST00000421832 TMEM198Q66K66 360 aa23.5■■□□□ 1.35
CTU1-201ENST00000421832 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
CTU1-201ENST00000421832 RAB2BQ8WUD1 216 aa23.5■■□□□ 1.35
CTU1-201ENST00000421832 MED8Q96G25 268 aa23.5■■□□□ 1.35
CTU1-201ENST00000421832 SLC45A3Q96JT2 553 aa23.5■■□□□ 1.35
CTU1-201ENST00000421832 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
CTU1-201ENST00000421832 TRAF6Q9Y4K3 522 aa23.5■■□□□ 1.35
CTU1-201ENST00000421832 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa23.5■■□□□ 1.35
CTU1-201ENST00000421832 AQP12BA6NM10 295 aa23.5■■□□□ 1.35
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