RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420138.5

GPC1-202, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene GPC1, Length 1,835 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-202ENST00000420138 PRR23BQ6ZRT6 265 aa20.09■□□□□ 0.81
GPC1-202ENST00000420138 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa20.09■□□□□ 0.81
GPC1-202ENST00000420138 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
GPC1-202ENST00000420138 LCN9Q8WX39 176 aa20.09■□□□□ 0.81
GPC1-202ENST00000420138 CXorf40BQ96DE9 158 aa20.09■□□□□ 0.81
GPC1-202ENST00000420138 PPM1MQ96MI6 270 aa20.09■□□□□ 0.81
GPC1-202ENST00000420138 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa20.09■□□□□ 0.81
GPC1-202ENST00000420138 VAPAQ9P0L0 249 aa20.09■□□□□ 0.81
GPC1-202ENST00000420138 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa20.09■□□□□ 0.81
GPC1-202ENST00000420138 BTBD3Q9Y2F9 522 aa20.09■□□□□ 0.81
GPC1-202ENST00000420138 DNAH14Q0VDD8 3507 aa20.09■□□□□ 0.81
GPC1-202ENST00000420138 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa20.09■□□□□ 0.81
GPC1-202ENST00000420138 BTN3A3O00478 584 aa20.09■□□□□ 0.81
GPC1-202ENST00000420138 AKAP10O43572 662 aa20.09■□□□□ 0.81
GPC1-202ENST00000420138 PCDH7O60245 1069 aa20.09■□□□□ 0.81
GPC1-202ENST00000420138 DFNA5O60443 496 aa20.09■□□□□ 0.81
GPC1-202ENST00000420138 SCN2BO60939 215 aa20.09■□□□□ 0.81
GPC1-202ENST00000420138 MYO1DO94832 1006 aa20.09■□□□□ 0.81
GPC1-202ENST00000420138 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
GPC1-202ENST00000420138 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
GPC1-202ENST00000420138 MAOBP27338 520 aa20.09■□□□□ 0.81
GPC1-202ENST00000420138 WNT3P56703 355 aa20.09■□□□□ 0.81
GPC1-202ENST00000420138 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
GPC1-202ENST00000420138 SELPLGQ14242 412 aa20.09■□□□□ 0.81
GPC1-202ENST00000420138 MAMSTRQ6ZN01 415 aa20.09■□□□□ 0.81
GPC1-202ENST00000420138 PARGQ86W56 976 aa20.09■□□□□ 0.81
GPC1-202ENST00000420138 OR7A2PQ8NGA2 310 aa20.09■□□□□ 0.81
GPC1-202ENST00000420138 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa20.09■□□□□ 0.81
GPC1-202ENST00000420138 ECSITQ9BQ95 431 aa20.09■□□□□ 0.81
GPC1-202ENST00000420138 MS4A8Q9BY19 250 aa20.09■□□□□ 0.81
GPC1-202ENST00000420138 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
GPC1-202ENST00000420138 GSDMCQ9BYG8 508 aa20.09■□□□□ 0.81
GPC1-202ENST00000420138 SLC6A13Q9NSD5 602 aa20.09■□□□□ 0.81
GPC1-202ENST00000420138 ADGRE2Q9UHX3 823 aa20.09■□□□□ 0.81
GPC1-202ENST00000420138 PCM1Q15154 2024 aa20.08■□□□□ 0.81
GPC1-202ENST00000420138 VGLL3A8MV65 326 aa20.08■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 KDM1AO60341 852 aa20.08■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 DNAJA2O60884 412 aa20.08■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 PTPN6P29350 595 aa20.08■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 S100A3P33764 101 aa20.08■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 PHEXP78562 749 aa20.08■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 ABATP80404 500 aa20.08■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 SPATS1Q496A3 300 aa20.08■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 TJAP1Q5JTD0 557 aa20.08■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 IZUMO2Q6UXV1 221 aa20.08■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 PLD3Q8IV08 490 aa20.08■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 MFSD2AQ8NA29 543 aa20.08■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 TECTAO75443 2155 aa20.07■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 KCNH1O95259 989 aa20.07■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 GBAP04062 536 aa20.07■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 GSK3BP49841 420 aa20.07■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 CYP4F2P78329 520 aa20.07■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 HKDC1Q2TB90 917 aa20.07■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 LRIF1Q5T3J3 769 aa20.07■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 DEPDC1Q5TB30 811 aa20.07■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa20.07■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 SLC9B2Q86UD5 537 aa20.07■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 C1orf216Q8TAB5 229 aa20.07■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 MUC3AQ02505 3323 aa20.07■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa20.06■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 ANKDD1BA6NHY2 528 aa20.06■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 YY2O15391 372 aa20.06■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 MAP3K13O43283 966 aa20.06■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 OR1F1O43749 312 aa20.06■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 ASMTP46597 345 aa20.06■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 LIPEQ05469 1076 aa20.06■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 GPR18Q14330 331 aa20.06■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 PGS1Q32NB8 556 aa20.06■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 GTDC1Q4AE62 458 aa20.06■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 PRRT3Q5FWE3 981 aa20.06■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 OR4F3Q6IEY1 312 aa20.06■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 ZNF425Q6IV72 752 aa20.06■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 ARPINQ7Z6K5 226 aa20.06■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 NAGSQ8N159 534 aa20.06■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 PQLC1Q8N2U9 271 aa20.06■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 OR8J2Q8NGG1 315 aa20.06■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 CREB3L4Q8TEY5 395 aa20.06■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 INPP5KQ9BT40 448 aa20.06■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 LRRC61Q9BV99 259 aa20.06■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 KLHL4Q9C0H6 718 aa20.06■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 KCNH6Q9H252 994 aa20.06■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 SYNPO2LQ9H987 977 aa20.06■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 TMEM184CQ9NVA4 438 aa20.06■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 ERVK-11Q9UQG0 969 aa20.06■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa20.06■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 TRBC2A0A5B9 178 aa20.06■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 GABRR3A8MPY1 467 aa20.06■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 PLPP1O14494 284 aa20.06■□□□□ 0.8
GPC1-202ENST00000420138 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms