RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 MOSPD3O75425 235 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 CLPXO76031 633 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 ANGPTL1O95841 491 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 B3GALT4O96024 378 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 AGXTP21549 392 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 ACVR2AP27037 513 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 RAE1P78406 368 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 RAPSNQ13702 412 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 LRRC73Q5JTD7 316 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 TMEM215Q68D42 235 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 ANKRD34AQ69YU3 496 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 FAHD1Q6P587 224 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 HORMAD1Q86X24 394 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 MIPOL1Q8TD10 442 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 OR4K3Q96R72 315 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 EPYCQ99645 322 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 PITX2Q99697 317 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 RAD21L1Q9H4I0 556 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 ATP6V1HQ9UI12 483 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 U3KQV3 271 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 TSPAN6O43657 245 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 LAMP1P11279 417 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 CD247P20963 164 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 IGFBP4P22692 258 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 XPAP23025 273 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 IMPA1P29218 277 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 PCGF2P35227 344 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 MMP12P39900 470 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 IL5RAQ01344 420 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 MVKQ03426 396 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 KIAA1958Q8N8K9 716 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 OR7G3Q8NG95 312 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 FUNDC2Q9BWH2 189 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 FAIMQ9NVQ4 179 aa22.92■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 OR2AG2A6NM03 316 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 GABRR3A8MPY1 467 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 ZNF197O14709 1029 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 IDSP22304 550 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 RPL3P39023 403 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 C21orf59P57076 290 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 SLC35A2P78381 396 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 GTF2H3Q13889 308 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 BCL7AQ4VC05 210 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 LY6G5CQ5SRR4 150 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 ERAP2Q6P179 960 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 CEP68Q76N32 757 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 NPAS3Q8IXF0 933 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 ZFP90Q8TF47 636 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 MYLIPQ8WY64 445 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 HSH2DQ96JZ2 352 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 CSF3RQ99062 836 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 PKP4Q99569 1192 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 EHD1Q9H4M9 534 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 REEP1Q9H902 201 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 LTB4R2Q9NPC1 389 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 ADPRHL2Q9NX46 363 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 VPS4AQ9UN37 437 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 ERVK-11Q9UQG0 969 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 PADI2Q9Y2J8 665 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 NDUFS2O75306 463 aa22.9■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP22.9■■□□□ 1.26
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PMS1-205ENST00000409985 IQCCQ4KMZ1 466 aa22.9■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 MED27Q6P2C8 311 aa22.9■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 CRTC3Q6UUV7 619 aa22.9■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 LIPIQ6XZB0 460 aa22.9■■□□□ 1.26
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PMS1-205ENST00000409985 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa22.9■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa22.9■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 C7orf34Q96L11 122 aa22.9■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa22.9■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 C9P02748 559 aa22.9■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 HOXA9P31269 272 aa22.9■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 CLECL1Q8IZS7 167 aa22.9■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 SVOPQ8N4V2 548 aa22.9■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PMS1-205ENST00000409985 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
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