RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401088.8

SZRD1-201, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SZRD1, Length 3,636 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-201ENST00000401088 LHCGRP22888 699 aa11.9□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 DAOAP59103 153 aa11.9□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 C9orf57Q5W0N0 161 aa11.9□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 CASP12Q6UXS9 341 aa11.9□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 MOB2Q70IA6 237 aa11.9□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 CRYBG2Q8N1P7 616 aa11.9□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 LRRC52Q8N7C0 313 aa11.9□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 C7orf57Q8NEG2 295 aa11.9□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa11.9□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 APH1BQ8WW43 257 aa11.9□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 KCTD7Q96MP8 289 aa11.9□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 SPNS1Q9H2V7 528 aa11.9□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 V9GYH0 126 aa11.9□□□□□ -0.5
SZRD1-201ENST00000401088 SLC28A1O00337 649 aa11.9□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 PROM1O43490 865 aa11.9□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 RPP40O75818 363 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 DNASE1P24855 282 aa11.9□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 RPS14P62263 151 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 MGAT3Q09327 533 aa11.9□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 SV2CQ496J9 727 aa11.9□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 DCAF15Q66K64 600 aa11.9□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 STK40Q8N2I9 435 aa11.9□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 OR8K5Q8NH50 307 aa11.9□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 FBLIM1Q8WUP2 373 aa11.9□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 ASZ1Q8WWH4 475 aa11.9□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 ZNF382Q96SR6 550 aa11.9□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 SEMA3CQ99985 751 aa11.9□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 FANCFQ9NPI8 374 aa11.9□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa11.9□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 PFDN2Q9UHV9 154 aa11.9□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 ADAMDEC1O15204 470 aa11.89□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 MAFKO60675 156 aa11.89□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 KDM4BO94953 1096 aa11.89□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 ANXA8P13928 327 aa11.89□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 ENGP17813 658 aa11.89□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 C4BPBP20851 252 aa11.89□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 PURAQ00577 322 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 SIRPB2Q5JXA9 342 aa11.89□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 WSCD1Q658N2 575 aa11.89□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 SLAIN1Q8ND83 568 aa11.89□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 REPS2Q8NFH8 660 aa11.89□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 SELENOMQ8WWX9 145 aa11.89□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 ZSWIM3Q96MP5 696 aa11.89□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 TSGA13Q96PP4 275 aa11.89□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 SLC6A15Q9H2J7 730 aa11.89□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa11.89□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 HRH3Q9Y5N1 445 aa11.89□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 FPGTO14772 594 aa11.89□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 GDF5P43026 501 aa11.89□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 KIR3DL1P43629 444 aa11.89□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 MAP2K6P52564 334 aa11.89□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 CAV3P56539 151 aa11.89□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 ARHGEF7Q14155 803 aa11.89□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 MFSD13AQ14CX5 517 aa11.89□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 HSD17B12Q53GQ0 312 aa11.89□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 OR4F3Q6IEY1 312 aa11.89□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 CNIH2Q6PI25 160 aa11.89□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 CLEC20AQ6ZU45 233 aa11.89□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 TAC4Q86UU9 113 aa11.89□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 LAPTM4BQ86VI4 370 aa11.89□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 DENND6BQ8NEG7 585 aa11.89□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 PIGUQ9H490 435 aa11.89□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 BEX1Q9HBH7 125 aa11.89□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 SIRT5Q9NXA8 310 aa11.89□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa11.89□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 STUB1Q9UNE7 303 aa11.89□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 POFUT2Q9Y2G5 429 aa11.89□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 PAGE1O75459 146 aa11.88□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 APOC3P02656 99 aa11.88□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 RAF1P04049 648 aa11.88□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 PRR35P0CG20 571 aa11.88□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 CBX5P45973 191 aa11.88□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 OR1E2P47887 323 aa11.88□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 CPT1AP50416 773 aa11.88□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 CASP9P55211 416 aa11.88□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 SLC10A7Q0GE19 358 aa11.88□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 VMACQ2NL98 169 aa11.88□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 TMEM81Q6P7N7 255 aa11.88□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa11.88□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 FOLH1BQ9HBA9 442 aa11.88□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 SLAMF7Q9NQ25 335 aa11.88□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 MLXQ9UH92 298 aa11.88□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa11.88□□□□□ -0.51
SZRD1-201ENST00000401088 NRCAMQ92823 1304 aa11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.1 ms