RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356384.4

RXRA-201, Transcript of retinoid X receptor alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RXRA, Length 5,770 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRA-201ENST00000356384 NCEH1Q6PIU2 408 aa15.61■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 TMEM156Q8N614 296 aa15.61■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 CAMKVQ8NCB2 501 aa15.61■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 OR6N1Q8NGY5 312 aa15.61■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 TCEAL3Q969E4 200 aa15.61■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 TMEM41AQ96HV5 264 aa15.61■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 HTR3EA5X5Y0 456 aa15.61■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 J3QRK9 145 aa15.61■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 VILLO15195 856 aa15.61■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 GJA1P17302 382 aa15.61■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 PIK3CBP42338 1070 aa15.61■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 CDH11P55287 796 aa15.61■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 HERV-K104P61576 105 aa15.61■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 OR8S1Q8NH09 359 aa15.61■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 FBXL8Q96CD0 374 aa15.61■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 XKR8Q9H6D3 395 aa15.61■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 CAPN14A8MX76 684 aa15.61■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 VSTM5A8MXK1 200 aa15.61■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 FBXO43Q4G163 708 aa15.61■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 PHF19Q5T6S3 580 aa15.61■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 MLIPQ5VWP3 458 aa15.61■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 CEACAM20Q6UY09 585 aa15.61■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 MFSD2AQ8NA29 543 aa15.61■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 CCM2Q9BSQ5 444 aa15.61■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 GRXCR1A8MXD5 290 aa15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 COQ9O75208 318 aa15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 C8orf89P0DMQ9 161 aa15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 GGT5P36269 586 aa15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 CHRNA6Q15825 494 aa15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 ANKRD23Q86SG2 305 aa15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 TSTD1Q8NFU3 115 aa15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 OR52B2Q96RD2 323 aa15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 TTTY10Q9BZA0 68 aa15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 NFAT5O94916 1531 aa15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 DISC1C4P0D8 188 aa15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 H3BSA7 217 aa15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 M0QX08 132 aa15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 HTR1AP08908 422 aa15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 NDUFS1P28331 727 aa15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 ASPAP45381 313 aa15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 FKBP1BP68106 108 aa15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 XKRXQ6PP77 449 aa15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 SLC15A3Q8IY34 581 aa15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 AP1S3Q96PC3 154 aa15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 Q9N2J8 555 aa15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 ERVK-18Q9QC07 812 aa15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 TLR6Q9Y2C9 796 aa15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 PEAK1Q9H792 1746 aa15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 ISPDA4D126 451 aa15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 BCKDHAP12694 445 aa15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 SMPD1P17405 629 aa15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 CD72P21854 359 aa15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 ST3GAL3Q11203 375 aa15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 SEC23BQ15437 767 aa15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 FAM189A2Q15884 450 aa15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 VMACQ2NL98 169 aa15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 ASPNQ9BXN1 380 aa15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 AKAP12Q02952 1782 aa15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 H0YJX3 145 aa15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 B4GALT2O60909 372 aa15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 PTNP21246 168 aa15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 E2F1Q01094 437 aa15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 RHDQ02161 417 aa15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 RAB39AQ14964 217 aa15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 TMEM68Q96MH6 324 aa15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 CD180Q99467 661 aa15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 GALPQ9UBC7 116 aa15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 CMAHPQ9Y471 501 aa15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 ZNF541Q9H0D2 1346 aa15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 A0A1B0GVI7 797 aa15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 AXIN1O15169 862 aa15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 GRIA1P42261 906 aa15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 SIRPB2Q5JXA9 342 aa15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 TSSK6Q9BXA6 273 aa15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 GRHPRQ9UBQ7 328 aa15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 LDB2O43679 373 aa15.59■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 FNTBP49356 437 aa15.59■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 ALG10BQ5I7T1 473 aa15.59■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 C6orf183Q5T699 404 aa15.59■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 TMEM164Q5U3C3 297 aa15.59■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 AADACL4Q5VUY2 407 aa15.59■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 VTCN1Q7Z7D3 282 aa15.59■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 NATD1Q8N6N6 113 aa15.59■□□□□ 0.09
RXRA-201ENST00000356384 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms