RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341408.5

VCX-201, Transcript of variable charge X-linked, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene VCX, Length 677 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCX-201ENST00000341408 GABREP78334 506 aa14.94□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 LCP2Q13094 533 aa14.94□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 STX3Q13277 289 aa14.94□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 RCN2Q14257 317 aa14.94□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 TBCCQ15814 346 aa14.94□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 C3orf38Q5JPI3 329 aa14.94□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 LETMD1Q6P1Q0 360 aa14.94□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa14.94□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 RNF44Q7L0R7 432 aa14.94□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 KRT78Q8N1N4 520 aa14.94□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 OR6Y1Q8NGX8 325 aa14.94□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 DYDC1Q8WWB3 177 aa14.94□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 WDR34Q96EX3 536 aa14.94□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 OR6C1Q96RD1 312 aa14.94□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 CMKLR1Q99788 373 aa14.94□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 CTRCQ99895 268 aa14.94□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa14.94□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 MACROD1Q9BQ69 325 aa14.94□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 NTMT1Q9BV86 223 aa14.94□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 APMAPQ9HDC9 416 aa14.94□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 PRM3Q9NNZ6 103 aa14.94□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa14.94□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 STARD5Q9NSY2 213 aa14.94□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 PISDQ9UG56 409 aa14.94□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 PLCL2Q9UPR0 1127 aa14.94□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa14.93□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 H0YGG7 62 aa14.93□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa14.93□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 SERPIND1P05546 499 aa14.93□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 PCNAP12004 261 aa14.93□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 EZRP15311 586 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 CXCR2P25025 360 aa14.93□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 SCTRP47872 440 aa14.93□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 PCDH1Q08174 1060 aa14.93□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 VAC14Q08AM6 782 aa14.93□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 TUBB3Q13509 450 aa14.93□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 LAPTM5Q13571 262 aa14.93□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 SGO1Q5FBB7 561 aa14.93□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 LIPJQ5W064 366 aa14.93□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa14.93□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 ADNP2Q6IQ32 1131 aa14.93□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 GRHL2Q6ISB3 625 aa14.93□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa14.93□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 RNF175Q8N4F7 328 aa14.93□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 CDYL2Q8N8U2 506 aa14.93□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 ANKRD53Q8N9V6 530 aa14.93□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 L3MBTL4Q8NA19 623 aa14.93□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 MFSD9Q8NBP5 474 aa14.93□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 OR1L3Q8NH93 324 aa14.93□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 AGAP11Q8TF27 550 aa14.93□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 OR2A5Q96R48 311 aa14.93□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 KCNA7Q96RP8 456 aa14.93□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 ZNF382Q96SR6 550 aa14.93□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 EFCAB11Q9BUY7 163 aa14.93□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 DPH1Q9BZG8 443 aa14.93□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 SEMA4CQ9C0C4 833 aa14.93□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 C20orf27Q9GZN8 174 aa14.93□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 DRC3Q9H069 523 aa14.93□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 EHD1Q9H4M9 534 aa14.93□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 MANSC1Q9H8J5 431 aa14.93□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 FGF21Q9NSA1 209 aa14.93□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 IRAK4Q9NWZ3 460 aa14.93□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 SLC39A1Q9NY26 324 aa14.93□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 SATB2Q9UPW6 733 aa14.93□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 FIS1Q9Y3D6 152 aa14.93□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 TIMM22Q9Y584 194 aa14.93□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 SLC28A2O43868 658 aa14.92□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 HSPA4LO95757 839 aa14.92□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 JMJD7P0C870 316 aa14.92□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 HNF4AP41235 474 aa14.92□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 SLC1A6P48664 564 aa14.92□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 FOXA1P55317 472 aa14.92□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 PKNOX1P55347 436 aa14.92□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 NAA20P61599 178 aa14.92□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 MC2RQ01718 297 aa14.92□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 ACY1Q03154 408 aa14.92□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 BST1Q10588 318 aa14.92□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 PAGE2BQ5JRK9 111 aa14.92□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa14.92□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 MED27Q6P2C8 311 aa14.92□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 CUZD1Q86UP6 607 aa14.92□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP14.92□□□□□ -0.02
VCX-201ENST00000341408 TBC1D19Q8N5T2 526 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms